Protein–RNA interactions for Protein: A0A0R4J054

4921501E09Rik, RIKEN cDNA 4921501E09, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921501E09RikA0A0R4J054 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
4921501E09RikA0A0R4J054 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
4921501E09RikA0A0R4J054 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4921501E09RikA0A0R4J054 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4921501E09RikA0A0R4J054 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
4921501E09RikA0A0R4J054 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
4921501E09RikA0A0R4J054 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
4921501E09RikA0A0R4J054 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4921501E09RikA0A0R4J054 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
4921501E09RikA0A0R4J054 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
4921501E09RikA0A0R4J054 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
4921501E09RikA0A0R4J054 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4921501E09RikA0A0R4J054 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
4921501E09RikA0A0R4J054 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4921501E09RikA0A0R4J054 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4921501E09RikA0A0R4J054 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4921501E09RikA0A0R4J054 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4921501E09RikA0A0R4J054 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4921501E09RikA0A0R4J054 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4921501E09RikA0A0R4J054 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4921501E09RikA0A0R4J054 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4921501E09RikA0A0R4J054 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4921501E09RikA0A0R4J054 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
4921501E09RikA0A0R4J054 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4921501E09RikA0A0R4J054 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
4921501E09RikA0A0R4J054 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4921501E09RikA0A0R4J054 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
4921501E09RikA0A0R4J054 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4921501E09RikA0A0R4J054 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4921501E09RikA0A0R4J054 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4921501E09RikA0A0R4J054 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4921501E09RikA0A0R4J054 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4921501E09RikA0A0R4J054 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4921501E09RikA0A0R4J054 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4921501E09RikA0A0R4J054 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4921501E09RikA0A0R4J054 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4921501E09RikA0A0R4J054 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4921501E09RikA0A0R4J054 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4921501E09RikA0A0R4J054 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4921501E09RikA0A0R4J054 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
4921501E09RikA0A0R4J054 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4921501E09RikA0A0R4J054 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4921501E09RikA0A0R4J054 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4921501E09RikA0A0R4J054 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4921501E09RikA0A0R4J054 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
4921501E09RikA0A0R4J054 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4921501E09RikA0A0R4J054 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
4921501E09RikA0A0R4J054 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4921501E09RikA0A0R4J054 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
4921501E09RikA0A0R4J054 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
4921501E09RikA0A0R4J054 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
4921501E09RikA0A0R4J054 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4921501E09RikA0A0R4J054 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4921501E09RikA0A0R4J054 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
4921501E09RikA0A0R4J054 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4921501E09RikA0A0R4J054 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4921501E09RikA0A0R4J054 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
4921501E09RikA0A0R4J054 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
4921501E09RikA0A0R4J054 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4921501E09RikA0A0R4J054 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4921501E09RikA0A0R4J054 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4921501E09RikA0A0R4J054 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4921501E09RikA0A0R4J054 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4921501E09RikA0A0R4J054 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
4921501E09RikA0A0R4J054 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
4921501E09RikA0A0R4J054 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4921501E09RikA0A0R4J054 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4921501E09RikA0A0R4J054 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4921501E09RikA0A0R4J054 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
4921501E09RikA0A0R4J054 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4921501E09RikA0A0R4J054 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4921501E09RikA0A0R4J054 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4921501E09RikA0A0R4J054 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4921501E09RikA0A0R4J054 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
4921501E09RikA0A0R4J054 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
4921501E09RikA0A0R4J054 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4921501E09RikA0A0R4J054 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
4921501E09RikA0A0R4J054 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4921501E09RikA0A0R4J054 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4921501E09RikA0A0R4J054 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4921501E09RikA0A0R4J054 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
4921501E09RikA0A0R4J054 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
4921501E09RikA0A0R4J054 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4921501E09RikA0A0R4J054 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
4921501E09RikA0A0R4J054 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4921501E09RikA0A0R4J054 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4921501E09RikA0A0R4J054 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
4921501E09RikA0A0R4J054 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
4921501E09RikA0A0R4J054 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms