Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC9.39□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC9.37□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC9.37□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.37□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC9.37□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC9.37□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC9.37□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.37□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC9.37□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC9.37□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms