Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YTW6

Scn2a, Sodium channel protein, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn2aA0A0J9YTW6 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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