Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YWX0

Ighv1-19, Immunoglobulin heavy variable V1-19 (Fragment), mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
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Ighv1-19A0A0A6YWX0 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Ighv1-19A0A0A6YWX0 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Ighv1-19A0A0A6YWX0 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Ighv1-19A0A0A6YWX0 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Ighv1-19A0A0A6YWX0 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Ighv1-19A0A0A6YWX0 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Ighv1-19A0A0A6YWX0 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Ighv1-19A0A0A6YWX0 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ighv1-19A0A0A6YWX0 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ighv1-19A0A0A6YWX0 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ighv1-19A0A0A6YWX0 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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Ighv1-19A0A0A6YWX0 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
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