Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WR25

Gm28360, Predicted gene 28360, mousemouse

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Length 190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28360A0A087WR25 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm28360A0A087WR25 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm28360A0A087WR25 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm28360A0A087WR25 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm28360A0A087WR25 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm28360A0A087WR25 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm28360A0A087WR25 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm28360A0A087WR25 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm28360A0A087WR25 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm28360A0A087WR25 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm28360A0A087WR25 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm28360A0A087WR25 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm28360A0A087WR25 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm28360A0A087WR25 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm28360A0A087WR25 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm28360A0A087WR25 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm28360A0A087WR25 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Gm28360A0A087WR25 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm28360A0A087WR25 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm28360A0A087WR25 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm28360A0A087WR25 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Gm28360A0A087WR25 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Gm28360A0A087WR25 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Gm28360A0A087WR25 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm28360A0A087WR25 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm28360A0A087WR25 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm28360A0A087WR25 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm28360A0A087WR25 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Gm28360A0A087WR25 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Gm28360A0A087WR25 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Gm28360A0A087WR25 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm28360A0A087WR25 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm28360A0A087WR25 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm28360A0A087WR25 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm28360A0A087WR25 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm28360A0A087WR25 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm28360A0A087WR25 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm28360A0A087WR25 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm28360A0A087WR25 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm28360A0A087WR25 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm28360A0A087WR25 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm28360A0A087WR25 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm28360A0A087WR25 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm28360A0A087WR25 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm28360A0A087WR25 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm28360A0A087WR25 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm28360A0A087WR25 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm28360A0A087WR25 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm28360A0A087WR25 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm28360A0A087WR25 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm28360A0A087WR25 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm28360A0A087WR25 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm28360A0A087WR25 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm28360A0A087WR25 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm28360A0A087WR25 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm28360A0A087WR25 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm28360A0A087WR25 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm28360A0A087WR25 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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