Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CCDC47Q96A33 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
CCDC47Q96A33 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CCDC47Q96A33 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
CCDC47Q96A33 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CCDC47Q96A33 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CCDC47Q96A33 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
CCDC47Q96A33 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
CCDC47Q96A33 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CCDC47Q96A33 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CCDC47Q96A33 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CCDC47Q96A33 RNU6-405P-201ENST00000516637 110 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CCDC47Q96A33 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CCDC47Q96A33 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CCDC47Q96A33 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CCDC47Q96A33 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CCDC47Q96A33 RNU6-259P-201ENST00000383999 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CCDC47Q96A33 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CCDC47Q96A33 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CCDC47Q96A33 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CCDC47Q96A33 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CCDC47Q96A33 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CCDC47Q96A33 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CCDC47Q96A33 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CCDC47Q96A33 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CCDC47Q96A33 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CCDC47Q96A33 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CCDC47Q96A33 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CCDC47Q96A33 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CCDC47Q96A33 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CCDC47Q96A33 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
CCDC47Q96A33 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
CCDC47Q96A33 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
CCDC47Q96A33 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CCDC47Q96A33 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CCDC47Q96A33 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
CCDC47Q96A33 AC006041.1-201ENST00000425322 328 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
CCDC47Q96A33 MTATP6P17-201ENST00000431030 672 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CCDC47Q96A33 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CCDC47Q96A33 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
CCDC47Q96A33 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CCDC47Q96A33 AC026407.1-201ENST00000518369 204 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CCDC47Q96A33 AL512360.1-201ENST00000555346 234 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CCDC47Q96A33 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CCDC47Q96A33 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CCDC47Q96A33 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CCDC47Q96A33 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
CCDC47Q96A33 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CCDC47Q96A33 AL359880.1-201ENST00000621879 266 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CCDC47Q96A33 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
CCDC47Q96A33 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
CCDC47Q96A33 AP000568.1-201ENST00000282964 442 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CCDC47Q96A33 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CCDC47Q96A33 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CCDC47Q96A33 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CCDC47Q96A33 SNORD116-9-201ENST00000384000 95 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CCDC47Q96A33 SNORD116-3-201ENST00000384287 95 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CCDC47Q96A33 SNORD116-7-201ENST00000384404 95 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CCDC47Q96A33 SNORD116-5-201ENST00000384462 95 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CCDC47Q96A33 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CCDC47Q96A33 RNU2-66P-201ENST00000410650 161 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CCDC47Q96A33 AC073626.1-201ENST00000415146 582 ntTSL 4 BASIC1.3□□□□□ -2.2
CCDC47Q96A33 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
CCDC47Q96A33 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CCDC47Q96A33 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
CCDC47Q96A33 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CCDC47Q96A33 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CCDC47Q96A33 Y_RNA.688-201ENST00000516565 95 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CCDC47Q96A33 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
CCDC47Q96A33 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
CCDC47Q96A33 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC1.3□□□□□ -2.2
CCDC47Q96A33 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CCDC47Q96A33 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CCDC47Q96A33 AC068137.3-201ENST00000639191 341 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CCDC47Q96A33 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CCDC47Q96A33 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CCDC47Q96A33 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CCDC47Q96A33 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CCDC47Q96A33 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CCDC47Q96A33 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CCDC47Q96A33 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CCDC47Q96A33 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CCDC47Q96A33 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CCDC47Q96A33 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CCDC47Q96A33 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CCDC47Q96A33 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CCDC47Q96A33 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CCDC47Q96A33 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CCDC47Q96A33 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CCDC47Q96A33 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CCDC47Q96A33 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
CCDC47Q96A33 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC1.29□□□□□ -2.2
CCDC47Q96A33 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CCDC47Q96A33 Z99129.1-201ENST00000612510 255 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CCDC47Q96A33 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CCDC47Q96A33 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CCDC47Q96A33 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CCDC47Q96A33 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
CCDC47Q96A33 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
CCDC47Q96A33 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
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