Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 MIR548S-201ENST00000581352 82 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 AL117351.2-201ENST00000513571 157 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
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SNAPC1Q16533 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SNAPC1Q16533 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SNAPC1Q16533 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SNAPC1Q16533 XGY1-201ENST00000381172 446 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SNAPC1Q16533 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SNAPC1Q16533 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SNAPC1Q16533 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SNAPC1Q16533 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SNAPC1Q16533 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SNAPC1Q16533 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SNAPC1Q16533 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SNAPC1Q16533 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SNAPC1Q16533 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SNAPC1Q16533 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SNAPC1Q16533 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SNAPC1Q16533 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
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SNAPC1Q16533 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
SNAPC1Q16533 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
SNAPC1Q16533 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SNAPC1Q16533 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SNAPC1Q16533 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SNAPC1Q16533 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SNAPC1Q16533 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SNAPC1Q16533 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
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SNAPC1Q16533 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
SNAPC1Q16533 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SNAPC1Q16533 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
SNAPC1Q16533 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SNAPC1Q16533 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SNAPC1Q16533 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SNAPC1Q16533 AC025253.1-201ENST00000613623 543 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SNAPC1Q16533 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SNAPC1Q16533 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SNAPC1Q16533 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SNAPC1Q16533 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SNAPC1Q16533 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
SNAPC1Q16533 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
SNAPC1Q16533 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
SNAPC1Q16533 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SNAPC1Q16533 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SNAPC1Q16533 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SNAPC1Q16533 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SNAPC1Q16533 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SNAPC1Q16533 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SNAPC1Q16533 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SNAPC1Q16533 UBE2V1P7-201ENST00000446395 340 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SNAPC1Q16533 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SNAPC1Q16533 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SNAPC1Q16533 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
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