Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RPE65Q16518 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RPE65Q16518 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RPE65Q16518 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RPE65Q16518 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RPE65Q16518 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RPE65Q16518 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RPE65Q16518 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RPE65Q16518 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RPE65Q16518 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RPE65Q16518 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RPE65Q16518 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RPE65Q16518 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
RPE65Q16518 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
RPE65Q16518 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RPE65Q16518 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RPE65Q16518 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RPE65Q16518 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RPE65Q16518 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RPE65Q16518 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RPE65Q16518 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC2.27□□□□□ -2.05
RPE65Q16518 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RPE65Q16518 AC099654.10-201ENST00000640395 161 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RPE65Q16518 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
RPE65Q16518 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RPE65Q16518 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RPE65Q16518 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RPE65Q16518 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RPE65Q16518 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RPE65Q16518 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RPE65Q16518 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
RPE65Q16518 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RPE65Q16518 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RPE65Q16518 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RPE65Q16518 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RPE65Q16518 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RPE65Q16518 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
RPE65Q16518 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
RPE65Q16518 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RPE65Q16518 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RPE65Q16518 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RPE65Q16518 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RPE65Q16518 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
RPE65Q16518 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RPE65Q16518 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
RPE65Q16518 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
RPE65Q16518 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC2.25□□□□□ -2.05
RPE65Q16518 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
RPE65Q16518 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
RPE65Q16518 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
RPE65Q16518 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RPE65Q16518 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RPE65Q16518 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RPE65Q16518 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RPE65Q16518 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RPE65Q16518 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RPE65Q16518 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RPE65Q16518 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RPE65Q16518 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RPE65Q16518 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RPE65Q16518 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
RPE65Q16518 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
RPE65Q16518 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RPE65Q16518 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
RPE65Q16518 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RPE65Q16518 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
RPE65Q16518 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RPE65Q16518 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
RPE65Q16518 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RPE65Q16518 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RPE65Q16518 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RPE65Q16518 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
RPE65Q16518 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
RPE65Q16518 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
RPE65Q16518 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
RPE65Q16518 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RPE65Q16518 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RPE65Q16518 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RPE65Q16518 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RPE65Q16518 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RPE65Q16518 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RPE65Q16518 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RPE65Q16518 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RPE65Q16518 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
RPE65Q16518 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RPE65Q16518 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RPE65Q16518 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RPE65Q16518 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RPE65Q16518 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RPE65Q16518 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RPE65Q16518 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RPE65Q16518 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RPE65Q16518 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RPE65Q16518 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RPE65Q16518 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RPE65Q16518 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RPE65Q16518 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
RPE65Q16518 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RPE65Q16518 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.24□□□□□ -2.05
RPE65Q16518 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
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