Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
GRIK4Q16099 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
GRIK4Q16099 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
GRIK4Q16099 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
GRIK4Q16099 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
GRIK4Q16099 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
GRIK4Q16099 Z98941.1-201ENST00000407764 100 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
GRIK4Q16099 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
GRIK4Q16099 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
GRIK4Q16099 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
GRIK4Q16099 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
GRIK4Q16099 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
GRIK4Q16099 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
GRIK4Q16099 YPEL5P2-201ENST00000605553 359 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
GRIK4Q16099 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
GRIK4Q16099 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
GRIK4Q16099 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
GRIK4Q16099 ZNF83-201ENST00000301096 2599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
GRIK4Q16099 PROS1-203ENST00000407433 3335 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
GRIK4Q16099 USP8P1-201ENST00000494673 3183 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GRIK4Q16099 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GRIK4Q16099 MUC19-205ENST00000454784 24775 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
GRIK4Q16099 ABCD2-201ENST00000308666 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
GRIK4Q16099 MGA-207ENST00000566586 14439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
GRIK4Q16099 RNU6-283P-201ENST00000364788 107 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GRIK4Q16099 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GRIK4Q16099 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GRIK4Q16099 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GRIK4Q16099 AC068295.1-201ENST00000413056 153 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
GRIK4Q16099 AC126124.2-201ENST00000413542 321 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GRIK4Q16099 AC023141.12-201ENST00000512399 199 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GRIK4Q16099 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GRIK4Q16099 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GRIK4Q16099 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GRIK4Q16099 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GRIK4Q16099 AL161457.2-203ENST00000590767 2663 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
GRIK4Q16099 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
GRIK4Q16099 LBR-202ENST00000338179 3812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
GRIK4Q16099 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
GRIK4Q16099 ADAT2-203ENST00000606514 6651 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
GRIK4Q16099 MME-211ENST00000492661 2854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
GRIK4Q16099 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
GRIK4Q16099 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
GRIK4Q16099 NCAM2-201ENST00000284894 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
GRIK4Q16099 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
GRIK4Q16099 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
GRIK4Q16099 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
GRIK4Q16099 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
GRIK4Q16099 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
GRIK4Q16099 RPS29P31-201ENST00000446147 164 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
GRIK4Q16099 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
GRIK4Q16099 AC026333.2-201ENST00000542164 106 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
GRIK4Q16099 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
GRIK4Q16099 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
GRIK4Q16099 hsa-mir-4776-1.1-201ENST00000636364 80 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
GRIK4Q16099 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
GRIK4Q16099 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
GRIK4Q16099 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
GRIK4Q16099 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
GRIK4Q16099 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.81
GRIK4Q16099 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.81
GRIK4Q16099 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
GRIK4Q16099 C2orf78-201ENST00000409561 3045 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
GRIK4Q16099 PPIP5K2-201ENST00000321521 15407 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
GRIK4Q16099 SULT1B1-201ENST00000310613 7115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
GRIK4Q16099 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
GRIK4Q16099 MIR423-201ENST00000362201 94 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
GRIK4Q16099 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
GRIK4Q16099 RNA5SP167-201ENST00000365461 116 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
GRIK4Q16099 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
GRIK4Q16099 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
GRIK4Q16099 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
GRIK4Q16099 RN7SL93P-201ENST00000463035 293 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
GRIK4Q16099 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
GRIK4Q16099 AF099810.1-201ENST00000554219 525 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
GRIK4Q16099 RMST_8.1-201ENST00000610287 165 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
GRIK4Q16099 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
GRIK4Q16099 ADGRL2-210ENST00000370728 6302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
GRIK4Q16099 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
GRIK4Q16099 SYTL2-203ENST00000359152 4123 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
GRIK4Q16099 OXR1-207ENST00000497705 2007 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
GRIK4Q16099 STEAP4-202ENST00000380079 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
GRIK4Q16099 PPIP5K2-215ENST00000613674 4933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
GRIK4Q16099 ERBIN-214ENST00000511297 4257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
GRIK4Q16099 KCNT2-202ENST00000367433 5883 ntTSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
GRIK4Q16099 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
GRIK4Q16099 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
GRIK4Q16099 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
GRIK4Q16099 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
GRIK4Q16099 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
GRIK4Q16099 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
GRIK4Q16099 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
GRIK4Q16099 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
GRIK4Q16099 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
GRIK4Q16099 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
GRIK4Q16099 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
GRIK4Q16099 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
GRIK4Q16099 AC078817.1-201ENST00000492623 435 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
GRIK4Q16099 AC099793.1-201ENST00000567538 285 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
GRIK4Q16099 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.2 ms