Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
VAMP3Q15836 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC0.48□□□□□ -2.33
VAMP3Q15836 AHI1-212ENST00000528103 441 ntTSL 1 (best) BASIC0.48□□□□□ -2.33
VAMP3Q15836 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC0.48□□□□□ -2.33
VAMP3Q15836 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
VAMP3Q15836 AL360219.1-201ENST00000610230 366 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
VAMP3Q15836 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC0.48□□□□□ -2.33
VAMP3Q15836 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
VAMP3Q15836 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.48□□□□□ -2.33
VAMP3Q15836 FGF7P2-201ENST00000332473 296 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
VAMP3Q15836 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
VAMP3Q15836 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
VAMP3Q15836 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
VAMP3Q15836 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
VAMP3Q15836 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
VAMP3Q15836 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
VAMP3Q15836 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
VAMP3Q15836 MTCO2P11-201ENST00000431069 680 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
VAMP3Q15836 AC099063.1-201ENST00000437128 324 ntTSL 5 BASIC0.47□□□□□ -2.33
VAMP3Q15836 AC244505.5-201ENST00000443639 207 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
VAMP3Q15836 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC0.47□□□□□ -2.33
VAMP3Q15836 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
VAMP3Q15836 AC092608.1-201ENST00000503505 267 ntTSL 2 BASIC0.47□□□□□ -2.33
VAMP3Q15836 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC0.47□□□□□ -2.33
VAMP3Q15836 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
VAMP3Q15836 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
VAMP3Q15836 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
VAMP3Q15836 MIR3913-1-201ENST00000577744 102 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
VAMP3Q15836 BNIP3P22-201ENST00000593399 556 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
VAMP3Q15836 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
VAMP3Q15836 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
VAMP3Q15836 AC072046.2-201ENST00000618366 268 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
VAMP3Q15836 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
VAMP3Q15836 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.46□□□□□ -2.34
VAMP3Q15836 RNU4-21P-201ENST00000362802 126 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
VAMP3Q15836 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
VAMP3Q15836 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
VAMP3Q15836 C20orf187-201ENST00000378252 446 ntTSL 2 BASIC0.46□□□□□ -2.34
VAMP3Q15836 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
VAMP3Q15836 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
VAMP3Q15836 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
VAMP3Q15836 AL049545.1-201ENST00000401856 572 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
VAMP3Q15836 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
VAMP3Q15836 MTCO2P7-201ENST00000446518 666 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
VAMP3Q15836 AC073415.1-201ENST00000449240 153 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
VAMP3Q15836 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
VAMP3Q15836 TPTE2P5-203ENST00000458118 728 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
VAMP3Q15836 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
VAMP3Q15836 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC0.46□□□□□ -2.34
VAMP3Q15836 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
VAMP3Q15836 AC091133.4-201ENST00000511142 308 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
VAMP3Q15836 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
VAMP3Q15836 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
VAMP3Q15836 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
VAMP3Q15836 AC009094.1-201ENST00000564443 426 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
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VAMP3Q15836 AC245884.10-201ENST00000597355 337 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
VAMP3Q15836 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
VAMP3Q15836 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
VAMP3Q15836 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
VAMP3Q15836 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
VAMP3Q15836 MT-TH-201ENST00000387441 69 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
VAMP3Q15836 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
VAMP3Q15836 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
VAMP3Q15836 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC0.45□□□□□ -2.34
VAMP3Q15836 AC060788.1-201ENST00000521318 469 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
VAMP3Q15836 AP000873.5-201ENST00000533906 236 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
VAMP3Q15836 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
VAMP3Q15836 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
VAMP3Q15836 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
VAMP3Q15836 MIR6798-201ENST00000612887 67 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
VAMP3Q15836 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
VAMP3Q15836 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
VAMP3Q15836 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.44□□□□□ -2.34
VAMP3Q15836 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC0.44□□□□□ -2.34
VAMP3Q15836 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
VAMP3Q15836 MTND2P18-201ENST00000419962 1030 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
VAMP3Q15836 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC0.44□□□□□ -2.34
VAMP3Q15836 MRPS10P2-201ENST00000431226 381 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
VAMP3Q15836 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC0.44□□□□□ -2.34
VAMP3Q15836 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
VAMP3Q15836 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
VAMP3Q15836 AC023794.1-201ENST00000504210 403 ntTSL 2 BASIC0.44□□□□□ -2.34
VAMP3Q15836 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
VAMP3Q15836 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
VAMP3Q15836 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC0.44□□□□□ -2.34
VAMP3Q15836 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
VAMP3Q15836 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
VAMP3Q15836 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
VAMP3Q15836 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
VAMP3Q15836 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
VAMP3Q15836 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
VAMP3Q15836 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
VAMP3Q15836 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
VAMP3Q15836 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
VAMP3Q15836 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
VAMP3Q15836 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
VAMP3Q15836 AL663109.1-201ENST00000411498 844 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
VAMP3Q15836 USP9YP29-201ENST00000445112 563 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
VAMP3Q15836 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
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