Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 AC093730.1-201ENST00000508825 448 ntTSL 3 BASIC0.78□□□□□ -2.28
PTPRKQ15262 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
PTPRKQ15262 AC245014.2-201ENST00000603689 287 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
PTPRKQ15262 AC246785.4-201ENST00000605374 287 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
PTPRKQ15262 AC004492.1-201ENST00000607036 742 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
PTPRKQ15262 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC0.77□□□□□ -2.29
PTPRKQ15262 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PTPRKQ15262 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PTPRKQ15262 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PTPRKQ15262 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PTPRKQ15262 RNY3P10-201ENST00000384764 102 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PTPRKQ15262 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.77□□□□□ -2.29
PTPRKQ15262 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PTPRKQ15262 AC090960.1-201ENST00000421072 306 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
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PTPRKQ15262 AC133104.1-201ENST00000429100 218 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PTPRKQ15262 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC0.77□□□□□ -2.29
PTPRKQ15262 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PTPRKQ15262 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC0.77□□□□□ -2.29
PTPRKQ15262 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
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PTPRKQ15262 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC0.77□□□□□ -2.29
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PTPRKQ15262 AF117829.1-203ENST00000520306 421 ntTSL 5 BASIC0.77□□□□□ -2.29
PTPRKQ15262 AP002963.1-201ENST00000530590 184 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PTPRKQ15262 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC0.77□□□□□ -2.29
PTPRKQ15262 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC0.77□□□□□ -2.29
PTPRKQ15262 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PTPRKQ15262 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PTPRKQ15262 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC0.77□□□□□ -2.29
PTPRKQ15262 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PTPRKQ15262 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.76□□□□□ -2.29
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PTPRKQ15262 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
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PTPRKQ15262 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC0.76□□□□□ -2.29
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PTPRKQ15262 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
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PTPRKQ15262 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC0.74□□□□□ -2.29
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PTPRKQ15262 AP001596.2-201ENST00000608410 312 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
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PTPRKQ15262 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
PTPRKQ15262 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
PTPRKQ15262 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
PTPRKQ15262 AC009299.3-201ENST00000421122 1072 ntTSL 3 BASIC0.73□□□□□ -2.29
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PTPRKQ15262 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC0.73□□□□□ -2.29
PTPRKQ15262 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
PTPRKQ15262 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
PTPRKQ15262 MTND1P22-201ENST00000510572 951 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
PTPRKQ15262 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
PTPRKQ15262 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
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