Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
BRD3Q15059 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
BRD3Q15059 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
BRD3Q15059 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
BRD3Q15059 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
BRD3Q15059 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
BRD3Q15059 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
BRD3Q15059 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
BRD3Q15059 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
BRD3Q15059 MTATP6P23-201ENST00000440153 476 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
BRD3Q15059 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
BRD3Q15059 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
BRD3Q15059 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
BRD3Q15059 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
BRD3Q15059 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
BRD3Q15059 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
BRD3Q15059 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
BRD3Q15059 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
BRD3Q15059 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
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BRD3Q15059 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
BRD3Q15059 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
BRD3Q15059 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
BRD3Q15059 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
BRD3Q15059 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
BRD3Q15059 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
BRD3Q15059 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
BRD3Q15059 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
BRD3Q15059 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
BRD3Q15059 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
BRD3Q15059 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
BRD3Q15059 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
BRD3Q15059 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
BRD3Q15059 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
BRD3Q15059 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
BRD3Q15059 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
BRD3Q15059 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
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BRD3Q15059 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
BRD3Q15059 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
BRD3Q15059 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
BRD3Q15059 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
BRD3Q15059 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
BRD3Q15059 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
BRD3Q15059 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
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BRD3Q15059 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
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BRD3Q15059 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
BRD3Q15059 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
BRD3Q15059 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
BRD3Q15059 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
BRD3Q15059 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
BRD3Q15059 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
BRD3Q15059 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
BRD3Q15059 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
BRD3Q15059 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
BRD3Q15059 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
BRD3Q15059 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
BRD3Q15059 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
BRD3Q15059 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
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BRD3Q15059 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
BRD3Q15059 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
BRD3Q15059 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
BRD3Q15059 MTND4LP11-201ENST00000422184 280 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
BRD3Q15059 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
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BRD3Q15059 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
BRD3Q15059 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
BRD3Q15059 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
BRD3Q15059 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
BRD3Q15059 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
BRD3Q15059 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
BRD3Q15059 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
BRD3Q15059 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
BRD3Q15059 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
BRD3Q15059 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
BRD3Q15059 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
BRD3Q15059 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
BRD3Q15059 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
BRD3Q15059 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
BRD3Q15059 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
BRD3Q15059 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
BRD3Q15059 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
BRD3Q15059 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
BRD3Q15059 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
BRD3Q15059 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
BRD3Q15059 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
BRD3Q15059 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
BRD3Q15059 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
BRD3Q15059 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
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