Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 AC006566.1-201ENST00000608943 513 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PDE6HQ13956 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PDE6HQ13956 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PDE6HQ13956 SOX2OT_exon1.1-201ENST00000614902 232 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PDE6HQ13956 AC010608.3-201ENST00000625048 527 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PDE6HQ13956 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PDE6HQ13956 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.21□□□□□ -2.38
PDE6HQ13956 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PDE6HQ13956 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PDE6HQ13956 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PDE6HQ13956 MIR620-201ENST00000385232 95 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PDE6HQ13956 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PDE6HQ13956 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PDE6HQ13956 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PDE6HQ13956 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC0.21□□□□□ -2.38
PDE6HQ13956 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PDE6HQ13956 AL162734.1-201ENST00000432858 157 ntTSL 5 BASIC0.21□□□□□ -2.38
PDE6HQ13956 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PDE6HQ13956 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PDE6HQ13956 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC0.21□□□□□ -2.38
PDE6HQ13956 AP003461.1-201ENST00000528866 78 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PDE6HQ13956 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PDE6HQ13956 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC0.21□□□□□ -2.38
PDE6HQ13956 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC0.21□□□□□ -2.38
PDE6HQ13956 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PDE6HQ13956 AL022161.1-201ENST00000604390 213 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PDE6HQ13956 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PDE6HQ13956 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PDE6HQ13956 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PDE6HQ13956 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PDE6HQ13956 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PDE6HQ13956 MTND4P4-201ENST00000439033 1366 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PDE6HQ13956 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PDE6HQ13956 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PDE6HQ13956 MTCO2P34-201ENST00000421994 607 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PDE6HQ13956 AL512656.1-201ENST00000427492 401 ntTSL 2 BASIC0.2□□□□□ -2.38
PDE6HQ13956 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PDE6HQ13956 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC0.2□□□□□ -2.38
PDE6HQ13956 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PDE6HQ13956 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PDE6HQ13956 GMFBP1-201ENST00000467831 427 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PDE6HQ13956 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PDE6HQ13956 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PDE6HQ13956 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PDE6HQ13956 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC0.2□□□□□ -2.38
PDE6HQ13956 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC0.2□□□□□ -2.38
PDE6HQ13956 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PDE6HQ13956 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
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PDE6HQ13956 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PDE6HQ13956 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PDE6HQ13956 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PDE6HQ13956 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PDE6HQ13956 PPEF1-AS1-201ENST00000430641 430 ntTSL 5 BASIC0.19□□□□□ -2.38
PDE6HQ13956 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC0.19□□□□□ -2.38
PDE6HQ13956 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PDE6HQ13956 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PDE6HQ13956 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PDE6HQ13956 MTCO2P7-201ENST00000446518 666 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PDE6HQ13956 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC0.19□□□□□ -2.38
PDE6HQ13956 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PDE6HQ13956 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PDE6HQ13956 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PDE6HQ13956 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PDE6HQ13956 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC0.19□□□□□ -2.38
PDE6HQ13956 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC0.19□□□□□ -2.38
PDE6HQ13956 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PDE6HQ13956 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PDE6HQ13956 AL670729.3-201ENST00000602345 574 ntTSL 4 BASIC0.19□□□□□ -2.38
PDE6HQ13956 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PDE6HQ13956 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PDE6HQ13956 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PDE6HQ13956 AP002371.2-201ENST00000624450 503 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PDE6HQ13956 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PDE6HQ13956 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PDE6HQ13956 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PDE6HQ13956 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PDE6HQ13956 AL663109.1-201ENST00000411498 844 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PDE6HQ13956 MTCO2P8-201ENST00000412213 658 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PDE6HQ13956 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PDE6HQ13956 AC009961.2-201ENST00000435771 251 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PDE6HQ13956 AC004854.1-201ENST00000440356 349 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PDE6HQ13956 AL354994.1-201ENST00000445967 194 ntTSL 5 BASIC0.18□□□□□ -2.38
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PDE6HQ13956 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC0.18□□□□□ -2.38
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PDE6HQ13956 PLSCR5-AS1-201ENST00000473817 450 ntTSL 3 BASIC0.18□□□□□ -2.38
PDE6HQ13956 AC106744.2-201ENST00000513955 898 ntTSL 5 BASIC0.18□□□□□ -2.38
PDE6HQ13956 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PDE6HQ13956 RNU6-311P-201ENST00000516224 102 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PDE6HQ13956 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PDE6HQ13956 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PDE6HQ13956 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PDE6HQ13956 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PDE6HQ13956 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PDE6HQ13956 MTND1P15-201ENST00000579262 949 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PDE6HQ13956 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PDE6HQ13956 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PDE6HQ13956 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PDE6HQ13956 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
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