Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TUBA3CQ13748 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
TUBA3CQ13748 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
TUBA3CQ13748 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
TUBA3CQ13748 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
TUBA3CQ13748 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
TUBA3CQ13748 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
TUBA3CQ13748 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TUBA3CQ13748 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TUBA3CQ13748 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TUBA3CQ13748 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TUBA3CQ13748 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TUBA3CQ13748 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TUBA3CQ13748 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TUBA3CQ13748 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TUBA3CQ13748 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TUBA3CQ13748 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TUBA3CQ13748 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TUBA3CQ13748 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TUBA3CQ13748 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
TUBA3CQ13748 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC2.96□□□□□ -1.94
TUBA3CQ13748 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TUBA3CQ13748 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TUBA3CQ13748 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
TUBA3CQ13748 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
TUBA3CQ13748 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TUBA3CQ13748 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TUBA3CQ13748 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TUBA3CQ13748 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TUBA3CQ13748 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
TUBA3CQ13748 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TUBA3CQ13748 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TUBA3CQ13748 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TUBA3CQ13748 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TUBA3CQ13748 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
TUBA3CQ13748 AL020994.3-201ENST00000449126 274 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
TUBA3CQ13748 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
TUBA3CQ13748 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
TUBA3CQ13748 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
TUBA3CQ13748 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TUBA3CQ13748 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TUBA3CQ13748 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TUBA3CQ13748 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TUBA3CQ13748 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TUBA3CQ13748 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
TUBA3CQ13748 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TUBA3CQ13748 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TUBA3CQ13748 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
TUBA3CQ13748 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
TUBA3CQ13748 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TUBA3CQ13748 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TUBA3CQ13748 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TUBA3CQ13748 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TUBA3CQ13748 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TUBA3CQ13748 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TUBA3CQ13748 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TUBA3CQ13748 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TUBA3CQ13748 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TUBA3CQ13748 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TUBA3CQ13748 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TUBA3CQ13748 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TUBA3CQ13748 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TUBA3CQ13748 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TUBA3CQ13748 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TUBA3CQ13748 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
TUBA3CQ13748 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TUBA3CQ13748 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
TUBA3CQ13748 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TUBA3CQ13748 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TUBA3CQ13748 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
TUBA3CQ13748 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
TUBA3CQ13748 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TUBA3CQ13748 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TUBA3CQ13748 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TUBA3CQ13748 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TUBA3CQ13748 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TUBA3CQ13748 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TUBA3CQ13748 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TUBA3CQ13748 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TUBA3CQ13748 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
TUBA3CQ13748 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
TUBA3CQ13748 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
TUBA3CQ13748 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TUBA3CQ13748 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TUBA3CQ13748 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
TUBA3CQ13748 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
TUBA3CQ13748 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
TUBA3CQ13748 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
TUBA3CQ13748 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TUBA3CQ13748 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
TUBA3CQ13748 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
TUBA3CQ13748 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
TUBA3CQ13748 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
TUBA3CQ13748 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TUBA3CQ13748 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TUBA3CQ13748 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TUBA3CQ13748 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TUBA3CQ13748 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TUBA3CQ13748 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TUBA3CQ13748 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
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