Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TUBB3Q13509 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TUBB3Q13509 MT-TR-201ENST00000387439 65 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TUBB3Q13509 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TUBB3Q13509 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TUBB3Q13509 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TUBB3Q13509 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TUBB3Q13509 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TUBB3Q13509 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TUBB3Q13509 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TUBB3Q13509 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TUBB3Q13509 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TUBB3Q13509 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TUBB3Q13509 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TUBB3Q13509 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TUBB3Q13509 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
TUBB3Q13509 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
TUBB3Q13509 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TUBB3Q13509 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
TUBB3Q13509 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TUBB3Q13509 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TUBB3Q13509 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TUBB3Q13509 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TUBB3Q13509 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC2.72□□□□□ -1.97
TUBB3Q13509 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TUBB3Q13509 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TUBB3Q13509 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TUBB3Q13509 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TUBB3Q13509 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TUBB3Q13509 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TUBB3Q13509 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TUBB3Q13509 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TUBB3Q13509 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TUBB3Q13509 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TUBB3Q13509 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
TUBB3Q13509 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TUBB3Q13509 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TUBB3Q13509 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TUBB3Q13509 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
TUBB3Q13509 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TUBB3Q13509 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
TUBB3Q13509 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC2.71□□□□□ -1.97
TUBB3Q13509 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC2.71□□□□□ -1.97
TUBB3Q13509 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
TUBB3Q13509 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TUBB3Q13509 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TUBB3Q13509 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TUBB3Q13509 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TUBB3Q13509 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TUBB3Q13509 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TUBB3Q13509 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
TUBB3Q13509 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TUBB3Q13509 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TUBB3Q13509 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TUBB3Q13509 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
TUBB3Q13509 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
TUBB3Q13509 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
TUBB3Q13509 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
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TUBB3Q13509 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TUBB3Q13509 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
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TUBB3Q13509 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
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TUBB3Q13509 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TUBB3Q13509 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TUBB3Q13509 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TUBB3Q13509 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TUBB3Q13509 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TUBB3Q13509 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TUBB3Q13509 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
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TUBB3Q13509 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
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TUBB3Q13509 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TUBB3Q13509 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
TUBB3Q13509 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TUBB3Q13509 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TUBB3Q13509 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TUBB3Q13509 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TUBB3Q13509 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TUBB3Q13509 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TUBB3Q13509 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TUBB3Q13509 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TUBB3Q13509 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TUBB3Q13509 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
TUBB3Q13509 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
TUBB3Q13509 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
TUBB3Q13509 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
TUBB3Q13509 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
TUBB3Q13509 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TUBB3Q13509 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TUBB3Q13509 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
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