Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
ITGB3BPQ13352 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.09□□□□□ -2.39
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.18-201ENST00000362461 102 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
ITGB3BPQ13352 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
ITGB3BPQ13352 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
ITGB3BPQ13352 LINC01674-201ENST00000427446 504 ntTSL 3 BASIC0.09□□□□□ -2.4
ITGB3BPQ13352 MTND1P20-201ENST00000430341 950 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
ITGB3BPQ13352 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC0.09□□□□□ -2.4
ITGB3BPQ13352 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
ITGB3BPQ13352 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
ITGB3BPQ13352 FGF14-AS1-202ENST00000451630 321 ntTSL 2 BASIC0.09□□□□□ -2.4
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ITGB3BPQ13352 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
ITGB3BPQ13352 AC234772.3-201ENST00000602277 528 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
ITGB3BPQ13352 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
ITGB3BPQ13352 RNU6-157P-201ENST00000383957 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ITGB3BPQ13352 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ITGB3BPQ13352 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ITGB3BPQ13352 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ITGB3BPQ13352 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ITGB3BPQ13352 AC106883.1-201ENST00000418805 562 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ITGB3BPQ13352 AL121957.1-201ENST00000441532 338 ntTSL 2 BASIC0.08□□□□□ -2.4
ITGB3BPQ13352 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ITGB3BPQ13352 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ITGB3BPQ13352 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ITGB3BPQ13352 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC0.08□□□□□ -2.4
ITGB3BPQ13352 AC093012.1-201ENST00000552999 446 ntTSL 3 BASIC0.08□□□□□ -2.4
ITGB3BPQ13352 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ITGB3BPQ13352 AC005304.3-201ENST00000581533 511 ntTSL 3 BASIC0.08□□□□□ -2.4
ITGB3BPQ13352 AC068790.2-201ENST00000602601 557 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ITGB3BPQ13352 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ITGB3BPQ13352 AC138749.5-201ENST00000611461 208 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ITGB3BPQ13352 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ITGB3BPQ13352 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC0.08□□□□□ -2.4
ITGB3BPQ13352 AC013437.2-201ENST00000639587 677 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ITGB3BPQ13352 AL390237.1-201ENST00000404226 1415 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
ITGB3BPQ13352 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
ITGB3BPQ13352 MIR1295A-201ENST00000408463 79 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
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ITGB3BPQ13352 AP003168.1-201ENST00000530091 307 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
ITGB3BPQ13352 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
ITGB3BPQ13352 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
ITGB3BPQ13352 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
ITGB3BPQ13352 AL078595.3-201ENST00000623815 1166 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
ITGB3BPQ13352 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
ITGB3BPQ13352 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
ITGB3BPQ13352 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC0.07□□□□□ -2.4
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ITGB3BPQ13352 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
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ITGB3BPQ13352 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
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ITGB3BPQ13352 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
ITGB3BPQ13352 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
ITGB3BPQ13352 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
ITGB3BPQ13352 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC0.06□□□□□ -2.4
ITGB3BPQ13352 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC0.06□□□□□ -2.4
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ITGB3BPQ13352 AP000907.4-201ENST00000604143 237 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ITGB3BPQ13352 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ITGB3BPQ13352 AC009159.2-201ENST00000617603 606 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ITGB3BPQ13352 AL031667.3-201ENST00000620124 655 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ITGB3BPQ13352 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.04□□□□□ -2.4
ITGB3BPQ13352 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ITGB3BPQ13352 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ITGB3BPQ13352 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ITGB3BPQ13352 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ITGB3BPQ13352 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ITGB3BPQ13352 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
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ITGB3BPQ13352 GYG2-AS1-201ENST00000445107 515 ntTSL 5 BASIC0.03□□□□□ -2.4
ITGB3BPQ13352 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ITGB3BPQ13352 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC0.03□□□□□ -2.4
ITGB3BPQ13352 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC0.03□□□□□ -2.4
ITGB3BPQ13352 MIR5190-201ENST00000581537 80 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
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