Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NME3Q13232 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NME3Q13232 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
NME3Q13232 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NME3Q13232 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NME3Q13232 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NME3Q13232 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NME3Q13232 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NME3Q13232 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NME3Q13232 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NME3Q13232 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NME3Q13232 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
NME3Q13232 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
NME3Q13232 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NME3Q13232 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NME3Q13232 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
NME3Q13232 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
NME3Q13232 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
NME3Q13232 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
NME3Q13232 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
NME3Q13232 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
NME3Q13232 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
NME3Q13232 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
NME3Q13232 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
NME3Q13232 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
NME3Q13232 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
NME3Q13232 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
NME3Q13232 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
NME3Q13232 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
NME3Q13232 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
NME3Q13232 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
NME3Q13232 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
NME3Q13232 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
NME3Q13232 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
NME3Q13232 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
NME3Q13232 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
NME3Q13232 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
NME3Q13232 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
NME3Q13232 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
NME3Q13232 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
NME3Q13232 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC1.47□□□□□ -2.17
NME3Q13232 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
NME3Q13232 AL359081.1-201ENST00000432083 615 ntTSL 2 BASIC1.47□□□□□ -2.17
NME3Q13232 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
NME3Q13232 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
NME3Q13232 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
NME3Q13232 AC011352.1-201ENST00000512300 793 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
NME3Q13232 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
NME3Q13232 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
NME3Q13232 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC1.47□□□□□ -2.17
NME3Q13232 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
NME3Q13232 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
NME3Q13232 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
NME3Q13232 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
NME3Q13232 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
NME3Q13232 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
NME3Q13232 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
NME3Q13232 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
NME3Q13232 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
NME3Q13232 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
NME3Q13232 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
NME3Q13232 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
NME3Q13232 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
NME3Q13232 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
NME3Q13232 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
NME3Q13232 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
NME3Q13232 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
NME3Q13232 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
NME3Q13232 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
NME3Q13232 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
NME3Q13232 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
NME3Q13232 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
NME3Q13232 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
NME3Q13232 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
NME3Q13232 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
NME3Q13232 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
NME3Q13232 AP003465.2-201ENST00000602571 373 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
NME3Q13232 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
NME3Q13232 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
NME3Q13232 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
NME3Q13232 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
NME3Q13232 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
NME3Q13232 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
NME3Q13232 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
NME3Q13232 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
NME3Q13232 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
NME3Q13232 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
NME3Q13232 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
NME3Q13232 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
NME3Q13232 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
NME3Q13232 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
NME3Q13232 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
NME3Q13232 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
NME3Q13232 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
NME3Q13232 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
NME3Q13232 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC1.45□□□□□ -2.18
NME3Q13232 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
NME3Q13232 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
NME3Q13232 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
NME3Q13232 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC1.45□□□□□ -2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.8 ms