Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
IFT88Q13099 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
IFT88Q13099 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
IFT88Q13099 AC107401.1-201ENST00000503426 685 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
IFT88Q13099 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
IFT88Q13099 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
IFT88Q13099 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
IFT88Q13099 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
IFT88Q13099 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
IFT88Q13099 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
IFT88Q13099 AL512360.1-201ENST00000555346 234 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
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IFT88Q13099 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
IFT88Q13099 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
IFT88Q13099 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
IFT88Q13099 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
IFT88Q13099 AC064807.4-201ENST00000607201 407 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
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IFT88Q13099 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
IFT88Q13099 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
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IFT88Q13099 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
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IFT88Q13099 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
IFT88Q13099 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
IFT88Q13099 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
IFT88Q13099 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.23
IFT88Q13099 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC1.15□□□□□ -2.23
IFT88Q13099 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
IFT88Q13099 AP003465.2-201ENST00000602571 373 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
IFT88Q13099 AC073534.2-201ENST00000620377 381 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
IFT88Q13099 MTND4P5-201ENST00000435821 1374 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
IFT88Q13099 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
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