Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
GRIN2AQ12879 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
GRIN2AQ12879 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
GRIN2AQ12879 AC009712.1-201ENST00000564938 316 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
GRIN2AQ12879 MIR5697-201ENST00000578045 78 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
GRIN2AQ12879 AL592221.1-201ENST00000605266 382 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
GRIN2AQ12879 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC-0.41□□□□□ -2.48
GRIN2AQ12879 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
GRIN2AQ12879 RNU6-236P-201ENST00000363886 106 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
GRIN2AQ12879 snoZ40.1-201ENST00000364540 72 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
GRIN2AQ12879 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
GRIN2AQ12879 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC-0.42□□□□□ -2.48
GRIN2AQ12879 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
GRIN2AQ12879 SNORA32.3-201ENST00000384772 121 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
GRIN2AQ12879 AL512656.1-201ENST00000427492 401 ntTSL 2 BASIC-0.42□□□□□ -2.48
GRIN2AQ12879 PTPRG-AS1-202ENST00000466893 823 ntTSL 4 BASIC-0.42□□□□□ -2.48
GRIN2AQ12879 ADI1P3-201ENST00000549509 470 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
GRIN2AQ12879 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
GRIN2AQ12879 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
GRIN2AQ12879 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
GRIN2AQ12879 RNU6-354P-201ENST00000383862 107 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
GRIN2AQ12879 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
GRIN2AQ12879 RNU6-207P-201ENST00000384137 107 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
GRIN2AQ12879 RNU6-610P-201ENST00000384264 107 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
GRIN2AQ12879 AL663109.1-201ENST00000411498 844 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
GRIN2AQ12879 AC096531.1-201ENST00000419107 107 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
GRIN2AQ12879 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
GRIN2AQ12879 AL355997.1-202ENST00000454361 610 ntTSL 3 BASIC-0.43□□□□□ -2.48
GRIN2AQ12879 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
GRIN2AQ12879 Z99497.2-201ENST00000603634 310 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
GRIN2AQ12879 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.43□□□□□ -2.48
GRIN2AQ12879 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
GRIN2AQ12879 RNU4-63P-201ENST00000411313 118 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
GRIN2AQ12879 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
GRIN2AQ12879 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
GRIN2AQ12879 AC091770.1-201ENST00000456513 373 ntTSL 2 BASIC-0.44□□□□□ -2.48
GRIN2AQ12879 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
GRIN2AQ12879 AC092925.1-201ENST00000470739 493 ntTSL 3 BASIC-0.44□□□□□ -2.48
GRIN2AQ12879 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
GRIN2AQ12879 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
GRIN2AQ12879 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
GRIN2AQ12879 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
GRIN2AQ12879 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC-0.45□□□□□ -2.48
GRIN2AQ12879 AC090960.1-201ENST00000421072 306 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
GRIN2AQ12879 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC-0.45□□□□□ -2.48
GRIN2AQ12879 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
GRIN2AQ12879 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
GRIN2AQ12879 Z99289.3-201ENST00000605586 594 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
GRIN2AQ12879 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
GRIN2AQ12879 MIR198-201ENST00000637333 62 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
GRIN2AQ12879 STARD6-201ENST00000307844 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.46□□□□□ -2.48
GRIN2AQ12879 U3.4-201ENST00000363352 213 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
GRIN2AQ12879 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
GRIN2AQ12879 RNU6-929P-201ENST00000384429 107 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
GRIN2AQ12879 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
GRIN2AQ12879 MIR601-201ENST00000385256 79 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
GRIN2AQ12879 MIR1284-201ENST00000408337 120 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
GRIN2AQ12879 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
GRIN2AQ12879 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
GRIN2AQ12879 LINC02353-201ENST00000515181 849 ntTSL 1 (best) BASIC-0.46□□□□□ -2.48
GRIN2AQ12879 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
GRIN2AQ12879 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
GRIN2AQ12879 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
GRIN2AQ12879 VN1R87P-201ENST00000596706 487 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
GRIN2AQ12879 FBXW7-AS1-201ENST00000605147 372 ntTSL 1 (best) BASIC-0.46□□□□□ -2.48
GRIN2AQ12879 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
GRIN2AQ12879 AL356596.1-201ENST00000624230 379 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
GRIN2AQ12879 Clostridiales-1.4-201ENST00000636807 150 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
GRIN2AQ12879 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
GRIN2AQ12879 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
GRIN2AQ12879 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
GRIN2AQ12879 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
GRIN2AQ12879 AL096799.1-201ENST00000425900 381 ntTSL 2 BASIC-0.47□□□□□ -2.48
GRIN2AQ12879 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC-0.47□□□□□ -2.48
GRIN2AQ12879 RN7SKP287-201ENST00000516546 266 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
GRIN2AQ12879 RNU6ATAC22P-201ENST00000516794 89 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
GRIN2AQ12879 DEFB130C-202ENST00000530001 230 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
GRIN2AQ12879 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
GRIN2AQ12879 BCRP9-201ENST00000605312 388 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
GRIN2AQ12879 AC097460.3-201ENST00000623099 442 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
GRIN2AQ12879 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
GRIN2AQ12879 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
GRIN2AQ12879 MIR593-201ENST00000384856 100 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
GRIN2AQ12879 MIR145-201ENST00000384967 88 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
GRIN2AQ12879 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
GRIN2AQ12879 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
GRIN2AQ12879 GYG2-AS1-201ENST00000445107 515 ntTSL 5 BASIC-0.48□□□□□ -2.49
GRIN2AQ12879 AC104137.1-201ENST00000503625 385 ntTSL 3 BASIC-0.48□□□□□ -2.49
GRIN2AQ12879 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC-0.48□□□□□ -2.49
GRIN2AQ12879 AHI1-212ENST00000528103 441 ntTSL 1 (best) BASIC-0.48□□□□□ -2.49
GRIN2AQ12879 CCDC7-207ENST00000535327 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC-0.48□□□□□ -2.49
GRIN2AQ12879 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
GRIN2AQ12879 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
GRIN2AQ12879 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC-0.48□□□□□ -2.49
GRIN2AQ12879 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
GRIN2AQ12879 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
GRIN2AQ12879 AL157373.1-201ENST00000456036 276 ntTSL 3 BASIC-0.48□□□□□ -2.49
GRIN2AQ12879 AC091917.1-201ENST00000506330 566 ntTSL 4 BASIC-0.48□□□□□ -2.49
GRIN2AQ12879 AC122133.1-201ENST00000613964 233 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
GRIN2AQ12879 MIR548AZ-201ENST00000616567 95 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 163.3 ms