Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TMPOP42166 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TMPOP42166 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TMPOP42166 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
TMPOP42166 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
TMPOP42166 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
TMPOP42166 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TMPOP42166 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TMPOP42166 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TMPOP42166 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TMPOP42166 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TMPOP42166 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TMPOP42166 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TMPOP42166 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TMPOP42166 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
TMPOP42166 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TMPOP42166 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
TMPOP42166 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TMPOP42166 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TMPOP42166 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TMPOP42166 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TMPOP42166 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TMPOP42166 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TMPOP42166 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TMPOP42166 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TMPOP42166 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TMPOP42166 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
TMPOP42166 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TMPOP42166 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TMPOP42166 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TMPOP42166 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
TMPOP42166 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.05
TMPOP42166 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TMPOP42166 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TMPOP42166 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TMPOP42166 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TMPOP42166 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TMPOP42166 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TMPOP42166 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TMPOP42166 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
TMPOP42166 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TMPOP42166 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TMPOP42166 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TMPOP42166 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
TMPOP42166 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TMPOP42166 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TMPOP42166 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TMPOP42166 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TMPOP42166 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TMPOP42166 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TMPOP42166 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TMPOP42166 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TMPOP42166 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TMPOP42166 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TMPOP42166 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TMPOP42166 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TMPOP42166 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TMPOP42166 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TMPOP42166 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TMPOP42166 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TMPOP42166 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
TMPOP42166 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TMPOP42166 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC2.26□□□□□ -2.05
TMPOP42166 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
TMPOP42166 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TMPOP42166 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
TMPOP42166 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TMPOP42166 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TMPOP42166 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
TMPOP42166 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
TMPOP42166 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TMPOP42166 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TMPOP42166 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TMPOP42166 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TMPOP42166 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.25□□□□□ -2.05
TMPOP42166 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TMPOP42166 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TMPOP42166 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
TMPOP42166 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
TMPOP42166 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TMPOP42166 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
TMPOP42166 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TMPOP42166 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TMPOP42166 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TMPOP42166 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
TMPOP42166 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
TMPOP42166 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TMPOP42166 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
TMPOP42166 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TMPOP42166 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TMPOP42166 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TMPOP42166 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
TMPOP42166 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TMPOP42166 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TMPOP42166 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TMPOP42166 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TMPOP42166 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TMPOP42166 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
TMPOP42166 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
TMPOP42166 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
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