Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
VPREB1P12018 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
VPREB1P12018 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
VPREB1P12018 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
VPREB1P12018 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
VPREB1P12018 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
VPREB1P12018 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
VPREB1P12018 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
VPREB1P12018 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
VPREB1P12018 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
VPREB1P12018 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
VPREB1P12018 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
VPREB1P12018 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
VPREB1P12018 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
VPREB1P12018 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
VPREB1P12018 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.75□□□□□ -2.13
VPREB1P12018 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
VPREB1P12018 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
VPREB1P12018 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
VPREB1P12018 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
VPREB1P12018 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
VPREB1P12018 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
VPREB1P12018 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
VPREB1P12018 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
VPREB1P12018 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
VPREB1P12018 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
VPREB1P12018 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
VPREB1P12018 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
VPREB1P12018 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
VPREB1P12018 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
VPREB1P12018 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
VPREB1P12018 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
VPREB1P12018 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
VPREB1P12018 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
VPREB1P12018 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
VPREB1P12018 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
VPREB1P12018 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
VPREB1P12018 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
VPREB1P12018 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
VPREB1P12018 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
VPREB1P12018 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
VPREB1P12018 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
VPREB1P12018 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
VPREB1P12018 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
VPREB1P12018 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
VPREB1P12018 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
VPREB1P12018 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
VPREB1P12018 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
VPREB1P12018 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
VPREB1P12018 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
VPREB1P12018 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
VPREB1P12018 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
VPREB1P12018 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
VPREB1P12018 AC012314.7-201ENST00000619693 93 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
VPREB1P12018 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
VPREB1P12018 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
VPREB1P12018 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
VPREB1P12018 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
VPREB1P12018 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
VPREB1P12018 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
VPREB1P12018 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
VPREB1P12018 5S_rRNA.1-201ENST00000364415 116 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
VPREB1P12018 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
VPREB1P12018 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
VPREB1P12018 MIR7-3-201ENST00000384898 110 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
VPREB1P12018 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
VPREB1P12018 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
VPREB1P12018 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
VPREB1P12018 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
VPREB1P12018 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
VPREB1P12018 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
VPREB1P12018 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
VPREB1P12018 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
VPREB1P12018 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
VPREB1P12018 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
VPREB1P12018 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
VPREB1P12018 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
VPREB1P12018 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
VPREB1P12018 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
VPREB1P12018 AC008739.3-201ENST00000603262 127 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
VPREB1P12018 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
VPREB1P12018 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
VPREB1P12018 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
VPREB1P12018 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
VPREB1P12018 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
VPREB1P12018 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
VPREB1P12018 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
VPREB1P12018 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
VPREB1P12018 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
VPREB1P12018 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
VPREB1P12018 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
VPREB1P12018 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
VPREB1P12018 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
VPREB1P12018 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
VPREB1P12018 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
VPREB1P12018 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
VPREB1P12018 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
VPREB1P12018 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
VPREB1P12018 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
VPREB1P12018 SNORA84-201ENST00000459229 133 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.4 ms