Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQD0

SCN8A, Sodium channel protein type 8 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,980 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.433-201ENST00000384089 102 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SCN8AQ9UQD0 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SCN8AQ9UQD0 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SCN8AQ9UQD0 AC106053.1-201ENST00000431697 368 ntTSL 3 BASIC0.19□□□□□ -2.38
SCN8AQ9UQD0 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC0.19□□□□□ -2.38
SCN8AQ9UQD0 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC0.19□□□□□ -2.38
SCN8AQ9UQD0 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SCN8AQ9UQD0 USP9YP25-201ENST00000457708 443 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SCN8AQ9UQD0 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SCN8AQ9UQD0 AC069114.1-201ENST00000580927 287 ntTSL 2 BASIC0.19□□□□□ -2.38
SCN8AQ9UQD0 AC080078.2-201ENST00000603766 501 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SCN8AQ9UQD0 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SCN8AQ9UQD0 MTND4P4-201ENST00000439033 1366 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SCN8AQ9UQD0 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SCN8AQ9UQD0 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SCN8AQ9UQD0 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC0.18□□□□□ -2.38
SCN8AQ9UQD0 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC0.18□□□□□ -2.38
SCN8AQ9UQD0 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC0.18□□□□□ -2.38
SCN8AQ9UQD0 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SCN8AQ9UQD0 BNIP3P40-201ENST00000596017 556 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SCN8AQ9UQD0 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SCN8AQ9UQD0 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SCN8AQ9UQD0 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SCN8AQ9UQD0 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SCN8AQ9UQD0 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SCN8AQ9UQD0 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SCN8AQ9UQD0 RNU6-348P-201ENST00000384386 107 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SCN8AQ9UQD0 RNU6-906P-201ENST00000384700 70 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SCN8AQ9UQD0 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC0.17□□□□□ -2.38
SCN8AQ9UQD0 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SCN8AQ9UQD0 AC092802.2-202ENST00000444665 371 ntTSL 5 BASIC0.17□□□□□ -2.38
SCN8AQ9UQD0 RSL24D1P11-201ENST00000591045 491 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SCN8AQ9UQD0 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SCN8AQ9UQD0 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SCN8AQ9UQD0 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SCN8AQ9UQD0 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SCN8AQ9UQD0 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SCN8AQ9UQD0 RNU6-1200P-201ENST00000384162 107 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SCN8AQ9UQD0 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SCN8AQ9UQD0 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SCN8AQ9UQD0 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC0.17□□□□□ -2.38
SCN8AQ9UQD0 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SCN8AQ9UQD0 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SCN8AQ9UQD0 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SCN8AQ9UQD0 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SCN8AQ9UQD0 PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 587 ntTSL 5 BASIC0.17□□□□□ -2.38
SCN8AQ9UQD0 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC0.17□□□□□ -2.38
SCN8AQ9UQD0 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SCN8AQ9UQD0 AC068792.1-201ENST00000621354 417 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SCN8AQ9UQD0 AL049777.1-201ENST00000622740 518 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SCN8AQ9UQD0 AC019226.2-201ENST00000625973 424 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
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SCN8AQ9UQD0 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC0.16□□□□□ -2.38
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SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SCN8AQ9UQD0 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SCN8AQ9UQD0 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SCN8AQ9UQD0 MIR329-2-201ENST00000385029 84 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SCN8AQ9UQD0 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SCN8AQ9UQD0 CETN4P-201ENST00000432407 469 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SCN8AQ9UQD0 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SCN8AQ9UQD0 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC0.16□□□□□ -2.38
SCN8AQ9UQD0 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC0.16□□□□□ -2.38
SCN8AQ9UQD0 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SCN8AQ9UQD0 AP000484.1-201ENST00000620067 1252 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SCN8AQ9UQD0 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC0.15□□□□□ -2.38
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC0.15□□□□□ -2.38
SCN8AQ9UQD0 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC0.15□□□□□ -2.38
SCN8AQ9UQD0 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC0.15□□□□□ -2.38
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SCN8AQ9UQD0 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC0.15□□□□□ -2.39
SCN8AQ9UQD0 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SCN8AQ9UQD0 AC027335.1-201ENST00000515377 543 ntTSL 4 BASIC0.15□□□□□ -2.39
SCN8AQ9UQD0 ZNF519P3-201ENST00000557158 1032 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SCN8AQ9UQD0 AC025917.1-202ENST00000566344 635 ntTSL 5 BASIC0.15□□□□□ -2.39
SCN8AQ9UQD0 AC097065.2-201ENST00000608159 533 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SCN8AQ9UQD0 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SCN8AQ9UQD0 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SCN8AQ9UQD0 C20orf187-201ENST00000378252 446 ntTSL 2 BASIC0.14□□□□□ -2.39
SCN8AQ9UQD0 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SCN8AQ9UQD0 AL355314.1-201ENST00000453639 316 ntTSL 5 BASIC0.14□□□□□ -2.39
SCN8AQ9UQD0 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SCN8AQ9UQD0 CFLAR-225ENST00000494258 693 ntTSL 3 BASIC0.14□□□□□ -2.39
SCN8AQ9UQD0 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SCN8AQ9UQD0 AC068137.4-201ENST00000638485 296 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SCN8AQ9UQD0 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.14□□□□□ -2.39
SCN8AQ9UQD0 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
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