Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.86□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC1.86□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 Y_RNA.702-201ENST00000516843 96 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC1.85□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 AC025253.1-201ENST00000613623 543 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
NPTX1Q15818 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.12
NPTX1Q15818 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
NPTX1Q15818 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
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