Protein–RNA interactions for Protein: Q15465

SHH, Sonic hedgehog protein, humanhuman

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHHQ15465 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
SHHQ15465 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SHHQ15465 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SHHQ15465 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SHHQ15465 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SHHQ15465 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SHHQ15465 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
SHHQ15465 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
SHHQ15465 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
SHHQ15465 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
SHHQ15465 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SHHQ15465 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SHHQ15465 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SHHQ15465 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SHHQ15465 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.56□□□□□ -2.16
SHHQ15465 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SHHQ15465 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SHHQ15465 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SHHQ15465 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SHHQ15465 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SHHQ15465 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SHHQ15465 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SHHQ15465 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SHHQ15465 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SHHQ15465 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SHHQ15465 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SHHQ15465 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
SHHQ15465 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SHHQ15465 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
SHHQ15465 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SHHQ15465 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SHHQ15465 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SHHQ15465 AC093249.1-201ENST00000567049 203 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SHHQ15465 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SHHQ15465 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SHHQ15465 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
SHHQ15465 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SHHQ15465 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SHHQ15465 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SHHQ15465 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SHHQ15465 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SHHQ15465 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SHHQ15465 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SHHQ15465 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SHHQ15465 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SHHQ15465 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SHHQ15465 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SHHQ15465 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SHHQ15465 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SHHQ15465 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SHHQ15465 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SHHQ15465 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SHHQ15465 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SHHQ15465 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SHHQ15465 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SHHQ15465 MTCYBP6-201ENST00000441810 138 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SHHQ15465 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SHHQ15465 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SHHQ15465 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SHHQ15465 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SHHQ15465 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SHHQ15465 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SHHQ15465 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SHHQ15465 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
SHHQ15465 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SHHQ15465 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SHHQ15465 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SHHQ15465 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SHHQ15465 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SHHQ15465 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SHHQ15465 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SHHQ15465 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SHHQ15465 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SHHQ15465 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SHHQ15465 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
SHHQ15465 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
SHHQ15465 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SHHQ15465 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SHHQ15465 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SHHQ15465 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SHHQ15465 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SHHQ15465 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SHHQ15465 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SHHQ15465 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SHHQ15465 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SHHQ15465 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SHHQ15465 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SHHQ15465 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SHHQ15465 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SHHQ15465 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SHHQ15465 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SHHQ15465 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SHHQ15465 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SHHQ15465 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SHHQ15465 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SHHQ15465 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SHHQ15465 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SHHQ15465 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SHHQ15465 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SHHQ15465 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
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