Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
GPNMBQ14956 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
GPNMBQ14956 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.16
GPNMBQ14956 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
GPNMBQ14956 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
GPNMBQ14956 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
GPNMBQ14956 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
GPNMBQ14956 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
GPNMBQ14956 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
GPNMBQ14956 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
GPNMBQ14956 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
GPNMBQ14956 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
GPNMBQ14956 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
GPNMBQ14956 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
GPNMBQ14956 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
GPNMBQ14956 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
GPNMBQ14956 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
GPNMBQ14956 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
GPNMBQ14956 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
GPNMBQ14956 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
GPNMBQ14956 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
GPNMBQ14956 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
GPNMBQ14956 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
GPNMBQ14956 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
GPNMBQ14956 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
GPNMBQ14956 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
GPNMBQ14956 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
GPNMBQ14956 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
GPNMBQ14956 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
GPNMBQ14956 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
GPNMBQ14956 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC1.53□□□□□ -2.17
GPNMBQ14956 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
GPNMBQ14956 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
GPNMBQ14956 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
GPNMBQ14956 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
GPNMBQ14956 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
GPNMBQ14956 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
GPNMBQ14956 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
GPNMBQ14956 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
GPNMBQ14956 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
GPNMBQ14956 AC098614.3-201ENST00000438957 440 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
GPNMBQ14956 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
GPNMBQ14956 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
GPNMBQ14956 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
GPNMBQ14956 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
GPNMBQ14956 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
GPNMBQ14956 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
GPNMBQ14956 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
GPNMBQ14956 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
GPNMBQ14956 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
GPNMBQ14956 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
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GPNMBQ14956 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
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GPNMBQ14956 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
GPNMBQ14956 AL355073.2-201ENST00000612106 557 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
GPNMBQ14956 WT1-AS_8.1-201ENST00000615200 275 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
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GPNMBQ14956 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
GPNMBQ14956 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
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GPNMBQ14956 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
GPNMBQ14956 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
GPNMBQ14956 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
GPNMBQ14956 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
GPNMBQ14956 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
GPNMBQ14956 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
GPNMBQ14956 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
GPNMBQ14956 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
GPNMBQ14956 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
GPNMBQ14956 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
GPNMBQ14956 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
GPNMBQ14956 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
GPNMBQ14956 MTATP6P23-201ENST00000440153 476 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
GPNMBQ14956 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
GPNMBQ14956 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
GPNMBQ14956 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
GPNMBQ14956 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
GPNMBQ14956 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
GPNMBQ14956 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
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