Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
BECN1Q14457 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
BECN1Q14457 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
BECN1Q14457 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
BECN1Q14457 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
BECN1Q14457 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
BECN1Q14457 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
BECN1Q14457 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
BECN1Q14457 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
BECN1Q14457 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
BECN1Q14457 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
BECN1Q14457 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
BECN1Q14457 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
BECN1Q14457 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
BECN1Q14457 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
BECN1Q14457 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
BECN1Q14457 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
BECN1Q14457 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
BECN1Q14457 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
BECN1Q14457 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
BECN1Q14457 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.92□□□□□ -2.1
BECN1Q14457 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
BECN1Q14457 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
BECN1Q14457 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
BECN1Q14457 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
BECN1Q14457 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
BECN1Q14457 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
BECN1Q14457 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
BECN1Q14457 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
BECN1Q14457 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
BECN1Q14457 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
BECN1Q14457 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
BECN1Q14457 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
BECN1Q14457 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
BECN1Q14457 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
BECN1Q14457 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
BECN1Q14457 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
BECN1Q14457 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
BECN1Q14457 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
BECN1Q14457 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
BECN1Q14457 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
BECN1Q14457 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
BECN1Q14457 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
BECN1Q14457 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
BECN1Q14457 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
BECN1Q14457 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
BECN1Q14457 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
BECN1Q14457 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
BECN1Q14457 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
BECN1Q14457 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
BECN1Q14457 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
BECN1Q14457 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
BECN1Q14457 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
BECN1Q14457 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
BECN1Q14457 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
BECN1Q14457 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
BECN1Q14457 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
BECN1Q14457 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
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BECN1Q14457 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
BECN1Q14457 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.91□□□□□ -2.1
BECN1Q14457 AC134698.4-201ENST00000523451 826 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
BECN1Q14457 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
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BECN1Q14457 CR383656.11-201ENST00000552261 498 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
BECN1Q14457 AC079907.1-201ENST00000552707 374 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
BECN1Q14457 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
BECN1Q14457 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
BECN1Q14457 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.1
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BECN1Q14457 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
BECN1Q14457 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
BECN1Q14457 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
BECN1Q14457 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
BECN1Q14457 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
BECN1Q14457 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
BECN1Q14457 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
BECN1Q14457 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
BECN1Q14457 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
BECN1Q14457 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
BECN1Q14457 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
BECN1Q14457 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
BECN1Q14457 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
BECN1Q14457 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
BECN1Q14457 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
BECN1Q14457 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
BECN1Q14457 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
BECN1Q14457 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
BECN1Q14457 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
BECN1Q14457 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
BECN1Q14457 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
BECN1Q14457 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
BECN1Q14457 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
BECN1Q14457 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
BECN1Q14457 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
BECN1Q14457 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
BECN1Q14457 RPL31P58-201ENST00000469001 379 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
BECN1Q14457 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
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