Protein–RNA interactions for Protein: Q14444

CAPRIN1, Caprin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPRIN1Q14444 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.8□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 MIR3671-201ENST00000580455 88 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC1.79□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.78□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 149.9 ms