Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
COL9A3Q14050 AC023669.2-201ENST00000436266 239 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
COL9A3Q14050 NDUFS5P3-201ENST00000450668 321 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
COL9A3Q14050 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
COL9A3Q14050 AC008948.1-201ENST00000506058 325 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
COL9A3Q14050 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
COL9A3Q14050 AC016597.1-201ENST00000564893 528 ntTSL 4 BASIC3.92□□□□□ -1.78
COL9A3Q14050 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
COL9A3Q14050 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
COL9A3Q14050 ZNF804B-202ENST00000611114 3968 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
COL9A3Q14050 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
COL9A3Q14050 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
COL9A3Q14050 AL589745.1-201ENST00000421190 3336 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
COL9A3Q14050 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
COL9A3Q14050 FRYL-205ENST00000503238 11103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
COL9A3Q14050 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
COL9A3Q14050 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
COL9A3Q14050 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
COL9A3Q14050 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
COL9A3Q14050 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
COL9A3Q14050 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
COL9A3Q14050 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
COL9A3Q14050 AC024022.1-202ENST00000508911 394 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
COL9A3Q14050 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
COL9A3Q14050 AC120045.1-201ENST00000563502 251 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
COL9A3Q14050 AC139426.2-201ENST00000568289 251 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
COL9A3Q14050 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
COL9A3Q14050 RPS6KA6-204ENST00000620340 8169 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
COL9A3Q14050 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
COL9A3Q14050 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
COL9A3Q14050 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
COL9A3Q14050 CKAP5-201ENST00000312055 6532 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
COL9A3Q14050 OR6C1-202ENST00000642104 2055 ntAPPRIS P1 BASIC3.91□□□□□ -1.78
COL9A3Q14050 AK9-204ENST00000424296 6326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
COL9A3Q14050 BAZ2B-202ENST00000343439 2364 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.78
COL9A3Q14050 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
COL9A3Q14050 SNORD73B-201ENST00000364394 72 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
COL9A3Q14050 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
COL9A3Q14050 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
COL9A3Q14050 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
COL9A3Q14050 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
COL9A3Q14050 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
COL9A3Q14050 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
COL9A3Q14050 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
COL9A3Q14050 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
COL9A3Q14050 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
COL9A3Q14050 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
COL9A3Q14050 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
COL9A3Q14050 uc_338.32-201ENST00000615087 172 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
COL9A3Q14050 OR9H1P-201ENST00000446393 4888 ntAPPRIS P1 BASIC3.9□□□□□ -1.79
COL9A3Q14050 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
COL9A3Q14050 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
COL9A3Q14050 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
COL9A3Q14050 BBX-206ENST00000415149 8930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
COL9A3Q14050 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
COL9A3Q14050 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
COL9A3Q14050 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
COL9A3Q14050 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
COL9A3Q14050 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
COL9A3Q14050 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
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COL9A3Q14050 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
COL9A3Q14050 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
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COL9A3Q14050 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
COL9A3Q14050 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
COL9A3Q14050 AC104027.1-201ENST00000521887 300 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
COL9A3Q14050 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
COL9A3Q14050 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
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COL9A3Q14050 MIR8058-201ENST00000615737 89 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
COL9A3Q14050 RBBP6-202ENST00000348022 5739 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
COL9A3Q14050 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
COL9A3Q14050 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
COL9A3Q14050 TMEM67-202ENST00000409623 3255 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
COL9A3Q14050 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
COL9A3Q14050 RNF38-201ENST00000259605 5012 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
COL9A3Q14050 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
COL9A3Q14050 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
COL9A3Q14050 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
COL9A3Q14050 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
COL9A3Q14050 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
COL9A3Q14050 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
COL9A3Q14050 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
COL9A3Q14050 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
COL9A3Q14050 RNU6-1073P-201ENST00000517182 106 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
COL9A3Q14050 AC107934.2-201ENST00000518653 310 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
COL9A3Q14050 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
COL9A3Q14050 MSANTD4-206ENST00000617528 508 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
COL9A3Q14050 AC027290.2-201ENST00000623210 18662 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
COL9A3Q14050 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
COL9A3Q14050 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
COL9A3Q14050 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
COL9A3Q14050 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
COL9A3Q14050 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
COL9A3Q14050 U3.15-201ENST00000365398 212 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
COL9A3Q14050 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
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