Protein–RNA interactions for Protein: Q13901

C1D, Nuclear nucleic acid-binding protein C1D, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1DQ13901 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
C1DQ13901 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
C1DQ13901 MTND4P5-201ENST00000435821 1374 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
C1DQ13901 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
C1DQ13901 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
C1DQ13901 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
C1DQ13901 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
C1DQ13901 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
C1DQ13901 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
C1DQ13901 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
C1DQ13901 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
C1DQ13901 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
C1DQ13901 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
C1DQ13901 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
C1DQ13901 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC0.53□□□□□ -2.32
C1DQ13901 AL512271.1-201ENST00000439878 434 ntTSL 3 BASIC0.53□□□□□ -2.32
C1DQ13901 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
C1DQ13901 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
C1DQ13901 AC023796.2-201ENST00000545410 451 ntTSL 3 BASIC0.53□□□□□ -2.32
C1DQ13901 AC090503.1-201ENST00000548029 729 ntTSL 3 BASIC0.53□□□□□ -2.32
C1DQ13901 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
C1DQ13901 AC068790.6-201ENST00000602558 258 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
C1DQ13901 AC245014.2-201ENST00000603689 287 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
C1DQ13901 AC246785.4-201ENST00000605374 287 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
C1DQ13901 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
C1DQ13901 RNU6-282P-201ENST00000365357 103 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
C1DQ13901 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
C1DQ13901 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
C1DQ13901 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC0.52□□□□□ -2.33
C1DQ13901 MAMDC2-AS1-205ENST00000451488 317 ntTSL 3 BASIC0.52□□□□□ -2.33
C1DQ13901 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
C1DQ13901 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
C1DQ13901 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
C1DQ13901 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
C1DQ13901 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
C1DQ13901 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
C1DQ13901 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
C1DQ13901 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC0.52□□□□□ -2.33
C1DQ13901 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
C1DQ13901 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
C1DQ13901 ANKRD20A17P-201ENST00000511745 1330 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
C1DQ13901 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC0.51□□□□□ -2.33
C1DQ13901 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
C1DQ13901 SNORA40.3-201ENST00000390964 122 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
C1DQ13901 LINC01312-201ENST00000412745 775 ntTSL 3 BASIC0.51□□□□□ -2.33
C1DQ13901 AL033528.1-201ENST00000453780 140 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
C1DQ13901 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
C1DQ13901 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
C1DQ13901 MTND3P3-201ENST00000505004 126 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
C1DQ13901 AC106744.2-201ENST00000513955 898 ntTSL 5 BASIC0.51□□□□□ -2.33
C1DQ13901 AC106038.2-201ENST00000520706 568 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
C1DQ13901 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC0.51□□□□□ -2.33
C1DQ13901 AP002963.1-201ENST00000530590 184 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
C1DQ13901 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
C1DQ13901 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
C1DQ13901 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
C1DQ13901 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
C1DQ13901 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
C1DQ13901 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
C1DQ13901 AC011458.1-201ENST00000604034 617 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
C1DQ13901 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
C1DQ13901 AC068792.1-201ENST00000621354 417 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
C1DQ13901 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
C1DQ13901 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.5□□□□□ -2.33
C1DQ13901 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
C1DQ13901 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC0.5□□□□□ -2.33
C1DQ13901 CETN4P-201ENST00000432407 469 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
C1DQ13901 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC0.5□□□□□ -2.33
C1DQ13901 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
C1DQ13901 LINC01491-201ENST00000558434 505 ntTSL 3 BASIC0.5□□□□□ -2.33
C1DQ13901 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
C1DQ13901 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
C1DQ13901 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
C1DQ13901 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
C1DQ13901 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
C1DQ13901 RNU6-584P-201ENST00000410350 95 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
C1DQ13901 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
C1DQ13901 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC0.49□□□□□ -2.33
C1DQ13901 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC0.49□□□□□ -2.33
C1DQ13901 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC0.49□□□□□ -2.33
C1DQ13901 AC133104.1-201ENST00000429100 218 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
C1DQ13901 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
C1DQ13901 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC0.49□□□□□ -2.33
C1DQ13901 PPEF1-AS1-201ENST00000430641 430 ntTSL 5 BASIC0.49□□□□□ -2.33
C1DQ13901 OFD1P4Y-201ENST00000455273 1179 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
C1DQ13901 LINC02064-202ENST00000507876 403 ntTSL 5 BASIC0.49□□□□□ -2.33
C1DQ13901 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
C1DQ13901 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
C1DQ13901 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
C1DQ13901 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
C1DQ13901 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC0.49□□□□□ -2.33
C1DQ13901 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
C1DQ13901 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
C1DQ13901 LINC00907-210ENST00000593316 847 ntTSL 3 BASIC0.49□□□□□ -2.33
C1DQ13901 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
C1DQ13901 LINC02033-202ENST00000623312 492 ntTSL 3 BASIC0.49□□□□□ -2.33
C1DQ13901 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC0.49□□□□□ -2.33
C1DQ13901 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
C1DQ13901 AC027514.1-201ENST00000588561 1603 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
C1DQ13901 AP000568.1-201ENST00000282964 442 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
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