Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.55
SPTAN1Q13813 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.55
SPTAN1Q13813 MIR382-201ENST00000637119 76 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.55
SPTAN1Q13813 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
SPTAN1Q13813 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
SPTAN1Q13813 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
SPTAN1Q13813 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
SPTAN1Q13813 AL050341.1-201ENST00000447743 313 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
SPTAN1Q13813 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
SPTAN1Q13813 AC093292.1-201ENST00000505050 449 ntTSL 3 BASIC-0.91□□□□□ -2.56
SPTAN1Q13813 AC079349.1-201ENST00000509096 589 ntTSL 2 BASIC-0.91□□□□□ -2.56
SPTAN1Q13813 VCAN-AS1-201ENST00000512090 424 ntTSL 3 BASIC-0.91□□□□□ -2.56
SPTAN1Q13813 RNU6-319P-201ENST00000516025 108 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
SPTAN1Q13813 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
SPTAN1Q13813 AC026616.1-201ENST00000523157 525 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
SPTAN1Q13813 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
SPTAN1Q13813 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
SPTAN1Q13813 uc_338.19-201ENST00000616808 99 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
SPTAN1Q13813 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
SPTAN1Q13813 SEC63P2-201ENST00000503863 1939 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
SPTAN1Q13813 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
SPTAN1Q13813 RNU6-1157P-201ENST00000384456 106 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
SPTAN1Q13813 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
SPTAN1Q13813 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
SPTAN1Q13813 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
SPTAN1Q13813 AC008883.1-201ENST00000506562 193 ntTSL 3 BASIC-0.92□□□□□ -2.56
SPTAN1Q13813 AC106744.2-201ENST00000513955 898 ntTSL 5 BASIC-0.92□□□□□ -2.56
SPTAN1Q13813 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
SPTAN1Q13813 AC107075.1-201ENST00000613695 314 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
SPTAN1Q13813 AL445584.3-201ENST00000617173 78 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
SPTAN1Q13813 MIR655-201ENST00000362159 97 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
SPTAN1Q13813 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
SPTAN1Q13813 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
SPTAN1Q13813 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
SPTAN1Q13813 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
SPTAN1Q13813 AC134698.4-201ENST00000523451 826 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
SPTAN1Q13813 MIR4677-201ENST00000584153 80 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
SPTAN1Q13813 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
SPTAN1Q13813 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
SPTAN1Q13813 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
SPTAN1Q13813 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
SPTAN1Q13813 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
SPTAN1Q13813 FCF1P9-201ENST00000412546 282 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
SPTAN1Q13813 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC-0.93□□□□□ -2.56
SPTAN1Q13813 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC-0.93□□□□□ -2.56
SPTAN1Q13813 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
SPTAN1Q13813 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
SPTAN1Q13813 DEFB131D-201ENST00000526803 184 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
SPTAN1Q13813 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
SPTAN1Q13813 POLR2KP1-201ENST00000553226 168 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
SPTAN1Q13813 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC-0.93□□□□□ -2.56
SPTAN1Q13813 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC-0.93□□□□□ -2.56
SPTAN1Q13813 MTCO2P23-201ENST00000425216 680 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
SPTAN1Q13813 LINC02379-201ENST00000505741 300 ntTSL 3 BASIC-0.93□□□□□ -2.56
SPTAN1Q13813 AC022022.2-201ENST00000602989 360 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
SPTAN1Q13813 AP000568.1-201ENST00000282964 442 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
SPTAN1Q13813 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
SPTAN1Q13813 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
SPTAN1Q13813 RNU6-1251P-201ENST00000364502 107 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
SPTAN1Q13813 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
SPTAN1Q13813 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC-0.94□□□□□ -2.56
SPTAN1Q13813 AC009468.1-201ENST00000412800 437 ntTSL 3 BASIC-0.94□□□□□ -2.56
SPTAN1Q13813 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC-0.94□□□□□ -2.56
SPTAN1Q13813 AL356583.2-201ENST00000426536 280 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
SPTAN1Q13813 OR6C5P-201ENST00000452388 923 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
SPTAN1Q13813 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
SPTAN1Q13813 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
SPTAN1Q13813 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC-0.94□□□□□ -2.56
SPTAN1Q13813 MIR5706-201ENST00000579841 80 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
SPTAN1Q13813 MTND3P19-201ENST00000603825 345 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
SPTAN1Q13813 RBM11P1-201ENST00000604951 799 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
SPTAN1Q13813 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
SPTAN1Q13813 LINC02033-202ENST00000623312 492 ntTSL 3 BASIC-0.94□□□□□ -2.56
SPTAN1Q13813 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
SPTAN1Q13813 Y_RNA.189-201ENST00000363959 112 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
SPTAN1Q13813 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
SPTAN1Q13813 AC092839.2-201ENST00000431130 377 ntTSL 3 BASIC-0.94□□□□□ -2.56
SPTAN1Q13813 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
SPTAN1Q13813 LRRC6P1-201ENST00000532188 885 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
SPTAN1Q13813 AC004067.1-201ENST00000608733 700 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
SPTAN1Q13813 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
SPTAN1Q13813 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC-0.95□□□□□ -2.56
SPTAN1Q13813 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
SPTAN1Q13813 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
SPTAN1Q13813 RPS24P1-201ENST00000438550 371 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
SPTAN1Q13813 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
SPTAN1Q13813 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
SPTAN1Q13813 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
SPTAN1Q13813 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
SPTAN1Q13813 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
SPTAN1Q13813 AC009313.1-201ENST00000425470 503 ntTSL 3 BASIC-0.95□□□□□ -2.56
SPTAN1Q13813 RPP40P1-201ENST00000426762 456 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
SPTAN1Q13813 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
SPTAN1Q13813 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
SPTAN1Q13813 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC-0.95□□□□□ -2.56
SPTAN1Q13813 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
SPTAN1Q13813 XACT-201ENST00000468762 497 ntTSL 5 BASIC-0.95□□□□□ -2.56
SPTAN1Q13813 AC092958.2-201ENST00000476987 492 ntTSL 3 BASIC-0.95□□□□□ -2.56
SPTAN1Q13813 RNA5SP66-201ENST00000517178 101 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
SPTAN1Q13813 AC113423.1-201ENST00000523279 289 ntTSL 3 BASIC-0.95□□□□□ -2.56
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