Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
PRPF4BQ13523 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PRPF4BQ13523 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
PRPF4BQ13523 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
PRPF4BQ13523 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PRPF4BQ13523 U6atac.1-201ENST00000616025 117 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PRPF4BQ13523 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PRPF4BQ13523 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PRPF4BQ13523 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
PRPF4BQ13523 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
PRPF4BQ13523 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PRPF4BQ13523 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PRPF4BQ13523 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PRPF4BQ13523 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PRPF4BQ13523 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PRPF4BQ13523 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
PRPF4BQ13523 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PRPF4BQ13523 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PRPF4BQ13523 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PRPF4BQ13523 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PRPF4BQ13523 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PRPF4BQ13523 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PRPF4BQ13523 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
PRPF4BQ13523 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PRPF4BQ13523 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
PRPF4BQ13523 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PRPF4BQ13523 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PRPF4BQ13523 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PRPF4BQ13523 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.1
PRPF4BQ13523 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
PRPF4BQ13523 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PRPF4BQ13523 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PRPF4BQ13523 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PRPF4BQ13523 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PRPF4BQ13523 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PRPF4BQ13523 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PRPF4BQ13523 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PRPF4BQ13523 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PRPF4BQ13523 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PRPF4BQ13523 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PRPF4BQ13523 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PRPF4BQ13523 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC1.9□□□□□ -2.11
PRPF4BQ13523 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PRPF4BQ13523 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PRPF4BQ13523 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
PRPF4BQ13523 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PRPF4BQ13523 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PRPF4BQ13523 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PRPF4BQ13523 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PRPF4BQ13523 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PRPF4BQ13523 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PRPF4BQ13523 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PRPF4BQ13523 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PRPF4BQ13523 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PRPF4BQ13523 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PRPF4BQ13523 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
PRPF4BQ13523 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PRPF4BQ13523 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
PRPF4BQ13523 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
PRPF4BQ13523 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PRPF4BQ13523 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
PRPF4BQ13523 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
PRPF4BQ13523 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
PRPF4BQ13523 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PRPF4BQ13523 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PRPF4BQ13523 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PRPF4BQ13523 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PRPF4BQ13523 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PRPF4BQ13523 Y_RNA.505-201ENST00000384489 102 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PRPF4BQ13523 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PRPF4BQ13523 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PRPF4BQ13523 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PRPF4BQ13523 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PRPF4BQ13523 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
PRPF4BQ13523 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
PRPF4BQ13523 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PRPF4BQ13523 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PRPF4BQ13523 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
PRPF4BQ13523 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PRPF4BQ13523 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PRPF4BQ13523 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PRPF4BQ13523 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PRPF4BQ13523 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PRPF4BQ13523 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
PRPF4BQ13523 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PRPF4BQ13523 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PRPF4BQ13523 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PRPF4BQ13523 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PRPF4BQ13523 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PRPF4BQ13523 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PRPF4BQ13523 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PRPF4BQ13523 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PRPF4BQ13523 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PRPF4BQ13523 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PRPF4BQ13523 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PRPF4BQ13523 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PRPF4BQ13523 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PRPF4BQ13523 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.87□□□□□ -2.11
PRPF4BQ13523 AP003033.1-201ENST00000527244 415 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PRPF4BQ13523 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
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