Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 AC106744.2-201ENST00000513955 898 ntTSL 5 BASIC-1.25□□□□□ -2.61
RPS29P62273 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
RPS29P62273 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
RPS29P62273 AL356804.1-201ENST00000553791 448 ntTSL 5 BASIC-1.25□□□□□ -2.61
RPS29P62273 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
RPS29P62273 AL445584.3-201ENST00000617173 78 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
RPS29P62273 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC-1.25□□□□□ -2.61
RPS29P62273 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
RPS29P62273 RNU5E-8P-201ENST00000363502 116 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
RPS29P62273 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
RPS29P62273 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
RPS29P62273 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
RPS29P62273 AL354733.1-204ENST00000412069 424 ntTSL 5 BASIC-1.26□□□□□ -2.61
RPS29P62273 AL158050.1-201ENST00000416077 457 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
RPS29P62273 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC-1.26□□□□□ -2.61
RPS29P62273 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
RPS29P62273 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
RPS29P62273 MTND1P31-201ENST00000449206 961 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
RPS29P62273 ART2BP-201ENST00000453501 499 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
RPS29P62273 AF129075.1-201ENST00000457162 794 ntTSL 3 BASIC-1.26□□□□□ -2.61
RPS29P62273 AL358176.1-201ENST00000457477 357 ntTSL 5 BASIC-1.26□□□□□ -2.61
RPS29P62273 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
RPS29P62273 RNU6-943P-201ENST00000516960 98 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
RPS29P62273 AP005530.1-201ENST00000572608 567 ntTSL 3 BASIC-1.26□□□□□ -2.61
RPS29P62273 MIR4280-201ENST00000582178 76 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
RPS29P62273 AC011509.1-201ENST00000589512 164 ntTSL 3 BASIC-1.26□□□□□ -2.61
RPS29P62273 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
RPS29P62273 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
RPS29P62273 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC-1.26□□□□□ -2.61
RPS29P62273 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
RPS29P62273 RNU6-650P-201ENST00000365658 111 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
RPS29P62273 MIR147A-201ENST00000385079 72 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
RPS29P62273 MIR876-201ENST00000401147 81 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
RPS29P62273 MIR1302-8-201ENST00000408342 128 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
RPS29P62273 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
RPS29P62273 AC009468.1-201ENST00000412800 437 ntTSL 3 BASIC-1.27□□□□□ -2.61
RPS29P62273 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC-1.27□□□□□ -2.61
RPS29P62273 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
RPS29P62273 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
RPS29P62273 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC-1.27□□□□□ -2.61
RPS29P62273 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
RPS29P62273 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
RPS29P62273 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
RPS29P62273 LINC02379-201ENST00000505741 300 ntTSL 3 BASIC-1.27□□□□□ -2.61
RPS29P62273 RNU5A-7P-201ENST00000515979 116 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
RPS29P62273 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
RPS29P62273 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC-1.27□□□□□ -2.61
RPS29P62273 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
RPS29P62273 AC092470.1-201ENST00000546187 132 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
RPS29P62273 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
RPS29P62273 MIR3179-1-201ENST00000578940 84 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
RPS29P62273 MIR3179-2-201ENST00000579107 84 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
RPS29P62273 MIR3179-3-201ENST00000579566 84 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
RPS29P62273 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
RPS29P62273 AC025588.3-201ENST00000604182 274 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
RPS29P62273 AC008536.2-201ENST00000607284 349 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
RPS29P62273 AC107075.1-201ENST00000613695 314 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
RPS29P62273 MIR3179-4-201ENST00000617599 84 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
RPS29P62273 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
RPS29P62273 AC083900.1-201ENST00000421964 469 ntTSL 2 BASIC-1.28□□□□□ -2.61
RPS29P62273 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC-1.28□□□□□ -2.61
RPS29P62273 AP003086.2-201ENST00000534168 437 ntTSL 3 BASIC-1.28□□□□□ -2.61
RPS29P62273 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
RPS29P62273 AC025917.1-202ENST00000566344 635 ntTSL 5 BASIC-1.28□□□□□ -2.61
RPS29P62273 MIR4504-201ENST00000577413 92 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
RPS29P62273 MIR4520-1-201ENST00000582609 70 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
RPS29P62273 AC122133.1-201ENST00000613964 233 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
RPS29P62273 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
RPS29P62273 Y_RNA.225-201ENST00000364326 97 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
RPS29P62273 Y_RNA.228-201ENST00000364346 98 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
RPS29P62273 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
RPS29P62273 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
RPS29P62273 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
RPS29P62273 FCF1P10-201ENST00000407590 479 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
RPS29P62273 USP9YP13-201ENST00000417797 480 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
RPS29P62273 AC004594.1-217ENST00000422260 325 ntTSL 2 BASIC-1.29□□□□□ -2.62
RPS29P62273 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
RPS29P62273 LINC01078-201ENST00000434832 387 ntTSL 5 BASIC-1.29□□□□□ -2.62
RPS29P62273 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
RPS29P62273 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
RPS29P62273 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC-1.29□□□□□ -2.62
RPS29P62273 AC113347.3-201ENST00000509113 148 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
RPS29P62273 VCAN-AS1-201ENST00000512090 424 ntTSL 3 BASIC-1.29□□□□□ -2.62
RPS29P62273 RNU6-1247P-201ENST00000516622 98 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
RPS29P62273 KLRF1-203ENST00000537723 598 ntTSL 1 (best) BASIC-1.29□□□□□ -2.62
RPS29P62273 AC124947.2-202ENST00000552735 133 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
RPS29P62273 AL118556.1-201ENST00000555257 502 ntTSL 2 BASIC-1.29□□□□□ -2.62
RPS29P62273 AL158050.2-201ENST00000605336 568 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
RPS29P62273 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
RPS29P62273 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC-1.3□□□□□ -2.62
RPS29P62273 RNU6-502P-201ENST00000362419 108 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
RPS29P62273 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
RPS29P62273 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
RPS29P62273 RNU6-119P-201ENST00000364882 107 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
RPS29P62273 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
RPS29P62273 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
RPS29P62273 SNORD56B-201ENST00000384713 71 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
RPS29P62273 MIR496-201ENST00000385226 102 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
RPS29P62273 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
RPS29P62273 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 239.2 ms