Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HOXA13P31271 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HOXA13P31271 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HOXA13P31271 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HOXA13P31271 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HOXA13P31271 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HOXA13P31271 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
HOXA13P31271 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC2.26□□□□□ -2.05
HOXA13P31271 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
HOXA13P31271 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HOXA13P31271 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HOXA13P31271 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HOXA13P31271 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HOXA13P31271 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HOXA13P31271 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HOXA13P31271 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HOXA13P31271 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HOXA13P31271 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HOXA13P31271 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HOXA13P31271 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HOXA13P31271 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HOXA13P31271 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HOXA13P31271 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
HOXA13P31271 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
HOXA13P31271 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HOXA13P31271 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HOXA13P31271 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HOXA13P31271 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HOXA13P31271 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HOXA13P31271 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HOXA13P31271 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
HOXA13P31271 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC2.24□□□□□ -2.05
HOXA13P31271 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HOXA13P31271 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HOXA13P31271 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HOXA13P31271 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HOXA13P31271 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HOXA13P31271 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HOXA13P31271 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HOXA13P31271 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HOXA13P31271 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HOXA13P31271 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HOXA13P31271 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HOXA13P31271 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HOXA13P31271 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
HOXA13P31271 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HOXA13P31271 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HOXA13P31271 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
HOXA13P31271 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HOXA13P31271 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HOXA13P31271 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HOXA13P31271 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HOXA13P31271 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HOXA13P31271 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HOXA13P31271 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HOXA13P31271 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HOXA13P31271 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HOXA13P31271 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
HOXA13P31271 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
HOXA13P31271 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC2.24□□□□□ -2.05
HOXA13P31271 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
HOXA13P31271 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HOXA13P31271 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HOXA13P31271 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HOXA13P31271 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HOXA13P31271 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
HOXA13P31271 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HOXA13P31271 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HOXA13P31271 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HOXA13P31271 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HOXA13P31271 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
HOXA13P31271 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
HOXA13P31271 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HOXA13P31271 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HOXA13P31271 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HOXA13P31271 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HOXA13P31271 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
HOXA13P31271 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HOXA13P31271 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HOXA13P31271 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HOXA13P31271 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HOXA13P31271 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
HOXA13P31271 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
HOXA13P31271 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HOXA13P31271 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HOXA13P31271 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HOXA13P31271 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HOXA13P31271 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HOXA13P31271 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HOXA13P31271 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HOXA13P31271 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HOXA13P31271 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
HOXA13P31271 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HOXA13P31271 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HOXA13P31271 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HOXA13P31271 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HOXA13P31271 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC2.22□□□□□ -2.05
HOXA13P31271 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
HOXA13P31271 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HOXA13P31271 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
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