Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUW8

TDP1, Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 608 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDP1Q9NUW8 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
TDP1Q9NUW8 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
TDP1Q9NUW8 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
TDP1Q9NUW8 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TDP1Q9NUW8 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TDP1Q9NUW8 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TDP1Q9NUW8 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TDP1Q9NUW8 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TDP1Q9NUW8 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
TDP1Q9NUW8 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
TDP1Q9NUW8 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TDP1Q9NUW8 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TDP1Q9NUW8 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TDP1Q9NUW8 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TDP1Q9NUW8 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TDP1Q9NUW8 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TDP1Q9NUW8 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
TDP1Q9NUW8 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TDP1Q9NUW8 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TDP1Q9NUW8 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
TDP1Q9NUW8 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
TDP1Q9NUW8 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
TDP1Q9NUW8 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
TDP1Q9NUW8 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
TDP1Q9NUW8 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TDP1Q9NUW8 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TDP1Q9NUW8 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TDP1Q9NUW8 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TDP1Q9NUW8 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TDP1Q9NUW8 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TDP1Q9NUW8 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TDP1Q9NUW8 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TDP1Q9NUW8 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TDP1Q9NUW8 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TDP1Q9NUW8 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TDP1Q9NUW8 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TDP1Q9NUW8 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TDP1Q9NUW8 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TDP1Q9NUW8 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TDP1Q9NUW8 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TDP1Q9NUW8 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TDP1Q9NUW8 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TDP1Q9NUW8 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TDP1Q9NUW8 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TDP1Q9NUW8 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TDP1Q9NUW8 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TDP1Q9NUW8 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TDP1Q9NUW8 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TDP1Q9NUW8 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TDP1Q9NUW8 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TDP1Q9NUW8 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
TDP1Q9NUW8 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TDP1Q9NUW8 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TDP1Q9NUW8 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TDP1Q9NUW8 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TDP1Q9NUW8 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TDP1Q9NUW8 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TDP1Q9NUW8 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TDP1Q9NUW8 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TDP1Q9NUW8 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TDP1Q9NUW8 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TDP1Q9NUW8 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
TDP1Q9NUW8 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TDP1Q9NUW8 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
TDP1Q9NUW8 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
TDP1Q9NUW8 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
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TDP1Q9NUW8 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TDP1Q9NUW8 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TDP1Q9NUW8 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TDP1Q9NUW8 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TDP1Q9NUW8 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
TDP1Q9NUW8 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
TDP1Q9NUW8 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TDP1Q9NUW8 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TDP1Q9NUW8 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
TDP1Q9NUW8 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
TDP1Q9NUW8 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TDP1Q9NUW8 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TDP1Q9NUW8 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TDP1Q9NUW8 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TDP1Q9NUW8 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TDP1Q9NUW8 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TDP1Q9NUW8 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TDP1Q9NUW8 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TDP1Q9NUW8 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TDP1Q9NUW8 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TDP1Q9NUW8 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TDP1Q9NUW8 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TDP1Q9NUW8 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TDP1Q9NUW8 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TDP1Q9NUW8 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TDP1Q9NUW8 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TDP1Q9NUW8 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TDP1Q9NUW8 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TDP1Q9NUW8 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TDP1Q9NUW8 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TDP1Q9NUW8 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TDP1Q9NUW8 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TDP1Q9NUW8 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
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