Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
LHX9Q9NQ69 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
LHX9Q9NQ69 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
LHX9Q9NQ69 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
LHX9Q9NQ69 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC1.38□□□□□ -2.19
LHX9Q9NQ69 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
LHX9Q9NQ69 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
LHX9Q9NQ69 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
LHX9Q9NQ69 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
LHX9Q9NQ69 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
LHX9Q9NQ69 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
LHX9Q9NQ69 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
LHX9Q9NQ69 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
LHX9Q9NQ69 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC1.38□□□□□ -2.19
LHX9Q9NQ69 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
LHX9Q9NQ69 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
LHX9Q9NQ69 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
LHX9Q9NQ69 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
LHX9Q9NQ69 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
LHX9Q9NQ69 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
LHX9Q9NQ69 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
LHX9Q9NQ69 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
LHX9Q9NQ69 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
LHX9Q9NQ69 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
LHX9Q9NQ69 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC1.38□□□□□ -2.19
LHX9Q9NQ69 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
LHX9Q9NQ69 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
LHX9Q9NQ69 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
LHX9Q9NQ69 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
LHX9Q9NQ69 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
LHX9Q9NQ69 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
LHX9Q9NQ69 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
LHX9Q9NQ69 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
LHX9Q9NQ69 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
LHX9Q9NQ69 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
LHX9Q9NQ69 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
LHX9Q9NQ69 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
LHX9Q9NQ69 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
LHX9Q9NQ69 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
LHX9Q9NQ69 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
LHX9Q9NQ69 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
LHX9Q9NQ69 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
LHX9Q9NQ69 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
LHX9Q9NQ69 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
LHX9Q9NQ69 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
LHX9Q9NQ69 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
LHX9Q9NQ69 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
LHX9Q9NQ69 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
LHX9Q9NQ69 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC1.37□□□□□ -2.19
LHX9Q9NQ69 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
LHX9Q9NQ69 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
LHX9Q9NQ69 DLGAP1-AS4-201ENST00000582054 757 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
LHX9Q9NQ69 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
LHX9Q9NQ69 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
LHX9Q9NQ69 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
LHX9Q9NQ69 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
LHX9Q9NQ69 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
LHX9Q9NQ69 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
LHX9Q9NQ69 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
LHX9Q9NQ69 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
LHX9Q9NQ69 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
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LHX9Q9NQ69 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
LHX9Q9NQ69 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
LHX9Q9NQ69 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
LHX9Q9NQ69 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.36□□□□□ -2.19
LHX9Q9NQ69 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
LHX9Q9NQ69 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
LHX9Q9NQ69 RNU6ATAC25P-201ENST00000408798 117 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
LHX9Q9NQ69 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
LHX9Q9NQ69 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
LHX9Q9NQ69 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
LHX9Q9NQ69 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
LHX9Q9NQ69 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
LHX9Q9NQ69 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
LHX9Q9NQ69 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
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LHX9Q9NQ69 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
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LHX9Q9NQ69 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
LHX9Q9NQ69 RNU6-358P-201ENST00000516564 75 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
LHX9Q9NQ69 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
LHX9Q9NQ69 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
LHX9Q9NQ69 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
LHX9Q9NQ69 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC1.36□□□□□ -2.19
LHX9Q9NQ69 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
LHX9Q9NQ69 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
LHX9Q9NQ69 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
LHX9Q9NQ69 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
LHX9Q9NQ69 U6atac.1-201ENST00000616025 117 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
LHX9Q9NQ69 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
LHX9Q9NQ69 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
LHX9Q9NQ69 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
LHX9Q9NQ69 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
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