Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
FAM3DQ96BQ1 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
FAM3DQ96BQ1 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.559-201ENST00000384686 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
FAM3DQ96BQ1 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
FAM3DQ96BQ1 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
FAM3DQ96BQ1 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
FAM3DQ96BQ1 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
FAM3DQ96BQ1 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
FAM3DQ96BQ1 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
FAM3DQ96BQ1 AL606534.3-201ENST00000437499 373 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
FAM3DQ96BQ1 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
FAM3DQ96BQ1 MTND1P1-201ENST00000445453 368 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
FAM3DQ96BQ1 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
FAM3DQ96BQ1 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
FAM3DQ96BQ1 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
FAM3DQ96BQ1 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
FAM3DQ96BQ1 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
FAM3DQ96BQ1 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
FAM3DQ96BQ1 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
FAM3DQ96BQ1 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
FAM3DQ96BQ1 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
FAM3DQ96BQ1 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
FAM3DQ96BQ1 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
FAM3DQ96BQ1 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
FAM3DQ96BQ1 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
FAM3DQ96BQ1 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
FAM3DQ96BQ1 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.13□□□□□ -2.23
FAM3DQ96BQ1 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
FAM3DQ96BQ1 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
FAM3DQ96BQ1 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
FAM3DQ96BQ1 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
FAM3DQ96BQ1 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
FAM3DQ96BQ1 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
FAM3DQ96BQ1 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
FAM3DQ96BQ1 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC1.13□□□□□ -2.23
FAM3DQ96BQ1 AC024909.2-201ENST00000553035 286 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
FAM3DQ96BQ1 ZNF519P2-201ENST00000557032 169 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
FAM3DQ96BQ1 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
FAM3DQ96BQ1 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
FAM3DQ96BQ1 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
FAM3DQ96BQ1 AC103591.3-201ENST00000608684 209 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
FAM3DQ96BQ1 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
FAM3DQ96BQ1 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
FAM3DQ96BQ1 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
FAM3DQ96BQ1 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
FAM3DQ96BQ1 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
FAM3DQ96BQ1 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.194-201ENST00000363985 102 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
FAM3DQ96BQ1 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
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FAM3DQ96BQ1 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
FAM3DQ96BQ1 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC1.12□□□□□ -2.23
FAM3DQ96BQ1 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
FAM3DQ96BQ1 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
FAM3DQ96BQ1 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
FAM3DQ96BQ1 GACAT1-202ENST00000441383 540 ntTSL 4 BASIC1.12□□□□□ -2.23
FAM3DQ96BQ1 Z83846.1-201ENST00000446798 265 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
FAM3DQ96BQ1 AL024497.2-201ENST00000457081 317 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
FAM3DQ96BQ1 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
FAM3DQ96BQ1 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
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FAM3DQ96BQ1 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
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FAM3DQ96BQ1 MTND1P5-201ENST00000517906 940 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
FAM3DQ96BQ1 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
FAM3DQ96BQ1 AP003033.1-201ENST00000527244 415 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
FAM3DQ96BQ1 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
FAM3DQ96BQ1 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
FAM3DQ96BQ1 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
FAM3DQ96BQ1 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
FAM3DQ96BQ1 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
FAM3DQ96BQ1 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
FAM3DQ96BQ1 AC048344.4-201ENST00000619744 527 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
FAM3DQ96BQ1 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
FAM3DQ96BQ1 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
FAM3DQ96BQ1 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
FAM3DQ96BQ1 RNU4-75P-201ENST00000364621 146 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
FAM3DQ96BQ1 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
FAM3DQ96BQ1 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
FAM3DQ96BQ1 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
FAM3DQ96BQ1 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
FAM3DQ96BQ1 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC1.11□□□□□ -2.23
FAM3DQ96BQ1 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
FAM3DQ96BQ1 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
FAM3DQ96BQ1 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
FAM3DQ96BQ1 MTND2P22-201ENST00000444325 1033 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
FAM3DQ96BQ1 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
FAM3DQ96BQ1 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
FAM3DQ96BQ1 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
FAM3DQ96BQ1 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
FAM3DQ96BQ1 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
FAM3DQ96BQ1 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
FAM3DQ96BQ1 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
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