Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 SNORD116-2-201ENST00000384274 95 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 SNORD116-6-201ENST00000384711 96 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 RNU2-66P-201ENST00000410650 161 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 AL365258.1-201ENST00000440885 247 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 MAMDC2-AS1-205ENST00000451488 317 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC1.04□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 AC023796.2-201ENST00000545410 451 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 NCRUPAR_2.1-201ENST00000616308 99 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 AL512271.1-201ENST00000439878 434 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 AC098826.2-201ENST00000452011 651 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 LINC01774-201ENST00000453569 595 ntTSL 2 BASIC1.03□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 AC104383.1-201ENST00000530297 370 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.25
ZBED9Q6R2W3 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
ZBED9Q6R2W3 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
ZBED9Q6R2W3 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
ZBED9Q6R2W3 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ZBED9Q6R2W3 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ZBED9Q6R2W3 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC1.02□□□□□ -2.25
ZBED9Q6R2W3 RNU6-259P-201ENST00000383999 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ZBED9Q6R2W3 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ZBED9Q6R2W3 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ZBED9Q6R2W3 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ZBED9Q6R2W3 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ZBED9Q6R2W3 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ZBED9Q6R2W3 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ZBED9Q6R2W3 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ZBED9Q6R2W3 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ZBED9Q6R2W3 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ZBED9Q6R2W3 AL121872.1-201ENST00000420327 281 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
ZBED9Q6R2W3 MRPS10P2-201ENST00000431226 381 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ZBED9Q6R2W3 MTCO2P3-201ENST00000442543 421 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ZBED9Q6R2W3 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC1.02□□□□□ -2.25
ZBED9Q6R2W3 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
ZBED9Q6R2W3 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ZBED9Q6R2W3 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ZBED9Q6R2W3 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
ZBED9Q6R2W3 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ZBED9Q6R2W3 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ZBED9Q6R2W3 RNU6-405P-201ENST00000516637 110 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ZBED9Q6R2W3 MTND2P38-201ENST00000522536 667 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ZBED9Q6R2W3 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ZBED9Q6R2W3 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ZBED9Q6R2W3 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
ZBED9Q6R2W3 AC103591.3-201ENST00000608684 209 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ZBED9Q6R2W3 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ZBED9Q6R2W3 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ZBED9Q6R2W3 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
ZBED9Q6R2W3 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
ZBED9Q6R2W3 RNU4-75P-201ENST00000364621 146 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ZBED9Q6R2W3 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ZBED9Q6R2W3 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ZBED9Q6R2W3 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ZBED9Q6R2W3 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ZBED9Q6R2W3 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
ZBED9Q6R2W3 MTND2P22-201ENST00000444325 1033 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ZBED9Q6R2W3 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC1.01□□□□□ -2.25
ZBED9Q6R2W3 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
ZBED9Q6R2W3 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
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