Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC1.84□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 FGF7P4-201ENST00000509595 295 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 AC134698.4-201ENST00000523451 826 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
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