Protein–RNA interactions for Protein: Q15036

SNX17, Sorting nexin-17, humanhuman

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX17Q15036 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SNX17Q15036 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SNX17Q15036 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SNX17Q15036 TET2-204ENST00000413648 4973 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
SNX17Q15036 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SNX17Q15036 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SNX17Q15036 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SNX17Q15036 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SNX17Q15036 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SNX17Q15036 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SNX17Q15036 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SNX17Q15036 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SNX17Q15036 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SNX17Q15036 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
SNX17Q15036 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SNX17Q15036 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SNX17Q15036 CHM-205ENST00000615443 2821 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
SNX17Q15036 AL161457.2-203ENST00000590767 2663 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SNX17Q15036 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
SNX17Q15036 PCDH11X-208ENST00000504220 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
SNX17Q15036 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
SNX17Q15036 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SNX17Q15036 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SNX17Q15036 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
SNX17Q15036 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SNX17Q15036 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SNX17Q15036 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SNX17Q15036 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SNX17Q15036 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SNX17Q15036 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SNX17Q15036 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SNX17Q15036 CENPBD1P1-201ENST00000464061 469 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SNX17Q15036 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SNX17Q15036 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SNX17Q15036 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SNX17Q15036 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SNX17Q15036 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SNX17Q15036 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SNX17Q15036 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SNX17Q15036 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SNX17Q15036 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SNX17Q15036 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SNX17Q15036 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SNX17Q15036 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SNX17Q15036 uc_338.1-201ENST00000612113 180 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SNX17Q15036 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SNX17Q15036 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SNX17Q15036 AC010733.2-201ENST00000589496 5702 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SNX17Q15036 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
SNX17Q15036 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SNX17Q15036 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SNX17Q15036 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
SNX17Q15036 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SNX17Q15036 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SNX17Q15036 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SNX17Q15036 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SNX17Q15036 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SNX17Q15036 AP002884.2-201ENST00000471647 395 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SNX17Q15036 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SNX17Q15036 NDUFB9P3-201ENST00000521269 501 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SNX17Q15036 AC093331.1-201ENST00000521474 169 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SNX17Q15036 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SNX17Q15036 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SNX17Q15036 TGIF1P1-201ENST00000558095 802 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SNX17Q15036 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SNX17Q15036 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SNX17Q15036 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SNX17Q15036 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
SNX17Q15036 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
SNX17Q15036 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SNX17Q15036 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SNX17Q15036 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SNX17Q15036 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SNX17Q15036 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SNX17Q15036 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SNX17Q15036 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SNX17Q15036 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SNX17Q15036 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SNX17Q15036 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SNX17Q15036 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SNX17Q15036 AC093274.1-201ENST00000503488 5454 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SNX17Q15036 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
SNX17Q15036 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SNX17Q15036 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SNX17Q15036 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
SNX17Q15036 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
SNX17Q15036 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
SNX17Q15036 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SNX17Q15036 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SNX17Q15036 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SNX17Q15036 RNU6-1168P-201ENST00000390831 104 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SNX17Q15036 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SNX17Q15036 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SNX17Q15036 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SNX17Q15036 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SNX17Q15036 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SNX17Q15036 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SNX17Q15036 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SNX17Q15036 RNU4ATAC15P-201ENST00000516415 126 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SNX17Q15036 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
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