Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
ALCAMQ13740 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ALCAMQ13740 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ALCAMQ13740 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ALCAMQ13740 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ALCAMQ13740 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ALCAMQ13740 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ALCAMQ13740 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
ALCAMQ13740 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ALCAMQ13740 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ALCAMQ13740 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ALCAMQ13740 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ALCAMQ13740 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ALCAMQ13740 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
ALCAMQ13740 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ALCAMQ13740 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC1.95□□□□□ -2.1
ALCAMQ13740 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ALCAMQ13740 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
ALCAMQ13740 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ALCAMQ13740 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
ALCAMQ13740 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ALCAMQ13740 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ALCAMQ13740 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ALCAMQ13740 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ALCAMQ13740 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ALCAMQ13740 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ALCAMQ13740 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
ALCAMQ13740 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ALCAMQ13740 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ALCAMQ13740 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ALCAMQ13740 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.94□□□□□ -2.1
ALCAMQ13740 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
ALCAMQ13740 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ALCAMQ13740 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ALCAMQ13740 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ALCAMQ13740 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ALCAMQ13740 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
ALCAMQ13740 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ALCAMQ13740 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
ALCAMQ13740 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ALCAMQ13740 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
ALCAMQ13740 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ALCAMQ13740 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ALCAMQ13740 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ALCAMQ13740 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ALCAMQ13740 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ALCAMQ13740 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
ALCAMQ13740 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ALCAMQ13740 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ALCAMQ13740 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ALCAMQ13740 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ALCAMQ13740 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ALCAMQ13740 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ALCAMQ13740 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ALCAMQ13740 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ALCAMQ13740 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ALCAMQ13740 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ALCAMQ13740 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ALCAMQ13740 MTND1P2-201ENST00000430604 821 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ALCAMQ13740 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
ALCAMQ13740 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ALCAMQ13740 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ALCAMQ13740 AL627309.4-201ENST00000496488 457 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
ALCAMQ13740 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ALCAMQ13740 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ALCAMQ13740 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ALCAMQ13740 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ALCAMQ13740 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ALCAMQ13740 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ALCAMQ13740 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
ALCAMQ13740 AP003033.1-201ENST00000527244 415 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ALCAMQ13740 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
ALCAMQ13740 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
ALCAMQ13740 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ALCAMQ13740 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
ALCAMQ13740 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ALCAMQ13740 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ALCAMQ13740 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
ALCAMQ13740 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ALCAMQ13740 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ALCAMQ13740 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ALCAMQ13740 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ALCAMQ13740 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ALCAMQ13740 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ALCAMQ13740 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ALCAMQ13740 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ALCAMQ13740 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ALCAMQ13740 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ALCAMQ13740 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ALCAMQ13740 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ALCAMQ13740 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ALCAMQ13740 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ALCAMQ13740 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ALCAMQ13740 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ALCAMQ13740 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
ALCAMQ13740 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
ALCAMQ13740 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ALCAMQ13740 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ALCAMQ13740 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ALCAMQ13740 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
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