Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
XRCC4Q13426 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
XRCC4Q13426 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC0.66□□□□□ -2.3
XRCC4Q13426 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
XRCC4Q13426 RNU6-282P-201ENST00000365357 103 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
XRCC4Q13426 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
XRCC4Q13426 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
XRCC4Q13426 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
XRCC4Q13426 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
XRCC4Q13426 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
XRCC4Q13426 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
XRCC4Q13426 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
XRCC4Q13426 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
XRCC4Q13426 ZNF736P12Y-201ENST00000443152 1243 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
XRCC4Q13426 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
XRCC4Q13426 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
XRCC4Q13426 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC0.65□□□□□ -2.31
XRCC4Q13426 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
XRCC4Q13426 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
XRCC4Q13426 RSL24D1P11-201ENST00000591045 491 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
XRCC4Q13426 LINC00907-210ENST00000593316 847 ntTSL 3 BASIC0.65□□□□□ -2.31
XRCC4Q13426 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
XRCC4Q13426 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
XRCC4Q13426 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.65□□□□□ -2.31
XRCC4Q13426 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC0.64□□□□□ -2.31
XRCC4Q13426 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
XRCC4Q13426 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
XRCC4Q13426 RNU6-925P-201ENST00000384629 104 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
XRCC4Q13426 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
XRCC4Q13426 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
XRCC4Q13426 LINC01312-201ENST00000412745 775 ntTSL 3 BASIC0.64□□□□□ -2.31
XRCC4Q13426 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC0.64□□□□□ -2.31
XRCC4Q13426 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
XRCC4Q13426 PPEF1-AS1-201ENST00000430641 430 ntTSL 5 BASIC0.64□□□□□ -2.31
XRCC4Q13426 AL359081.1-201ENST00000432083 615 ntTSL 2 BASIC0.64□□□□□ -2.31
XRCC4Q13426 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC0.64□□□□□ -2.31
XRCC4Q13426 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
XRCC4Q13426 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
XRCC4Q13426 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC0.64□□□□□ -2.31
XRCC4Q13426 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC0.64□□□□□ -2.31
XRCC4Q13426 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
XRCC4Q13426 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
XRCC4Q13426 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC0.64□□□□□ -2.31
XRCC4Q13426 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
XRCC4Q13426 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC0.64□□□□□ -2.31
XRCC4Q13426 AL391840.1-201ENST00000571144 367 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
XRCC4Q13426 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
XRCC4Q13426 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
XRCC4Q13426 Z99497.2-201ENST00000603634 310 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
XRCC4Q13426 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
XRCC4Q13426 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
XRCC4Q13426 AC004223.4-201ENST00000612426 332 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
XRCC4Q13426 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
XRCC4Q13426 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC0.64□□□□□ -2.31
XRCC4Q13426 MTND4P4-201ENST00000439033 1366 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
XRCC4Q13426 AL162734.1-201ENST00000432858 157 ntTSL 5 BASIC0.63□□□□□ -2.31
XRCC4Q13426 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
XRCC4Q13426 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
XRCC4Q13426 MTND2P14-201ENST00000482139 351 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
XRCC4Q13426 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
XRCC4Q13426 AC005178.1-201ENST00000508392 440 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
XRCC4Q13426 AC007834.2-201ENST00000536310 343 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
XRCC4Q13426 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
XRCC4Q13426 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC0.63□□□□□ -2.31
XRCC4Q13426 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC0.63□□□□□ -2.31
XRCC4Q13426 AC005014.3-201ENST00000605985 190 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
XRCC4Q13426 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
XRCC4Q13426 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
XRCC4Q13426 RNU4-28P-201ENST00000364739 141 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
XRCC4Q13426 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
XRCC4Q13426 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
XRCC4Q13426 RNU6-297P-201ENST00000384636 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
XRCC4Q13426 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
XRCC4Q13426 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
XRCC4Q13426 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
XRCC4Q13426 LINC01717-201ENST00000415754 527 ntTSL 5 BASIC0.62□□□□□ -2.31
XRCC4Q13426 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC0.62□□□□□ -2.31
XRCC4Q13426 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC0.62□□□□□ -2.31
XRCC4Q13426 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC0.62□□□□□ -2.31
XRCC4Q13426 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC0.62□□□□□ -2.31
XRCC4Q13426 AL355314.1-201ENST00000453639 316 ntTSL 5 BASIC0.62□□□□□ -2.31
XRCC4Q13426 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
XRCC4Q13426 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
XRCC4Q13426 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
XRCC4Q13426 AC091544.5-202ENST00000568297 374 ntTSL 3 BASIC0.62□□□□□ -2.31
XRCC4Q13426 AC005304.3-201ENST00000581533 511 ntTSL 3 BASIC0.62□□□□□ -2.31
XRCC4Q13426 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
XRCC4Q13426 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
XRCC4Q13426 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
XRCC4Q13426 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC0.61□□□□□ -2.31
XRCC4Q13426 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC0.61□□□□□ -2.31
XRCC4Q13426 Y_RNA.560-201ENST00000384689 102 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
XRCC4Q13426 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
XRCC4Q13426 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
XRCC4Q13426 LINC01323-201ENST00000486767 576 ntTSL 3 BASIC0.61□□□□□ -2.31
XRCC4Q13426 AL139147.1-201ENST00000502413 1156 ntTSL 2 BASIC0.61□□□□□ -2.31
XRCC4Q13426 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC0.61□□□□□ -2.31
XRCC4Q13426 AC106744.2-201ENST00000513955 898 ntTSL 5 BASIC0.61□□□□□ -2.31
XRCC4Q13426 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC0.61□□□□□ -2.31
XRCC4Q13426 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
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