Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
MSLNQ13421 AC096558.1-203ENST00000550516 574 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
MSLNQ13421 CR383656.11-201ENST00000552261 498 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
MSLNQ13421 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
MSLNQ13421 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
MSLNQ13421 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
MSLNQ13421 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
MSLNQ13421 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
MSLNQ13421 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
MSLNQ13421 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
MSLNQ13421 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
MSLNQ13421 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
MSLNQ13421 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
MSLNQ13421 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
MSLNQ13421 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
MSLNQ13421 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
MSLNQ13421 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
MSLNQ13421 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
MSLNQ13421 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
MSLNQ13421 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
MSLNQ13421 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
MSLNQ13421 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
MSLNQ13421 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
MSLNQ13421 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
MSLNQ13421 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
MSLNQ13421 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
MSLNQ13421 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
MSLNQ13421 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
MSLNQ13421 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
MSLNQ13421 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
MSLNQ13421 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
MSLNQ13421 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC1.7□□□□□ -2.14
MSLNQ13421 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
MSLNQ13421 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
MSLNQ13421 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
MSLNQ13421 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
MSLNQ13421 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
MSLNQ13421 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
MSLNQ13421 Y_RNA.390-201ENST00000383932 102 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
MSLNQ13421 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
MSLNQ13421 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
MSLNQ13421 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
MSLNQ13421 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
MSLNQ13421 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
MSLNQ13421 AL844175.1-201ENST00000455153 323 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
MSLNQ13421 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
MSLNQ13421 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
MSLNQ13421 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
MSLNQ13421 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
MSLNQ13421 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
MSLNQ13421 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
MSLNQ13421 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
MSLNQ13421 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
MSLNQ13421 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
MSLNQ13421 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
MSLNQ13421 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC1.69□□□□□ -2.14
MSLNQ13421 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
MSLNQ13421 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
MSLNQ13421 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
MSLNQ13421 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
MSLNQ13421 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
MSLNQ13421 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
MSLNQ13421 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
MSLNQ13421 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
MSLNQ13421 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
MSLNQ13421 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
MSLNQ13421 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
MSLNQ13421 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
MSLNQ13421 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
MSLNQ13421 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
MSLNQ13421 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
MSLNQ13421 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
MSLNQ13421 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
MSLNQ13421 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
MSLNQ13421 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
MSLNQ13421 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
MSLNQ13421 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
MSLNQ13421 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
MSLNQ13421 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
MSLNQ13421 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
MSLNQ13421 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
MSLNQ13421 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
MSLNQ13421 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
MSLNQ13421 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
MSLNQ13421 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
MSLNQ13421 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
MSLNQ13421 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
MSLNQ13421 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
MSLNQ13421 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
MSLNQ13421 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
MSLNQ13421 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
MSLNQ13421 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
MSLNQ13421 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
MSLNQ13421 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
MSLNQ13421 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
MSLNQ13421 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
MSLNQ13421 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
MSLNQ13421 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
MSLNQ13421 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
MSLNQ13421 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 150.5 ms