Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
LRRTM2O43300 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
LRRTM2O43300 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
LRRTM2O43300 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC1.79□□□□□ -2.12
LRRTM2O43300 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
LRRTM2O43300 MTND3P10-201ENST00000450967 341 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
LRRTM2O43300 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
LRRTM2O43300 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
LRRTM2O43300 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
LRRTM2O43300 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
LRRTM2O43300 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
LRRTM2O43300 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
LRRTM2O43300 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
LRRTM2O43300 MIR548S-201ENST00000581352 82 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
LRRTM2O43300 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
LRRTM2O43300 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
LRRTM2O43300 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
LRRTM2O43300 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
LRRTM2O43300 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
LRRTM2O43300 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.12
LRRTM2O43300 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
LRRTM2O43300 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
LRRTM2O43300 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
LRRTM2O43300 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
LRRTM2O43300 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
LRRTM2O43300 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
LRRTM2O43300 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
LRRTM2O43300 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
LRRTM2O43300 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
LRRTM2O43300 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
LRRTM2O43300 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
LRRTM2O43300 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
LRRTM2O43300 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
LRRTM2O43300 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
LRRTM2O43300 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
LRRTM2O43300 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
LRRTM2O43300 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
LRRTM2O43300 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
LRRTM2O43300 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC1.78□□□□□ -2.12
LRRTM2O43300 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
LRRTM2O43300 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
LRRTM2O43300 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
LRRTM2O43300 WT1-AS_8.1-201ENST00000615200 275 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
LRRTM2O43300 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC1.78□□□□□ -2.12
LRRTM2O43300 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.13
LRRTM2O43300 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
LRRTM2O43300 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
LRRTM2O43300 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
LRRTM2O43300 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
LRRTM2O43300 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
LRRTM2O43300 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
LRRTM2O43300 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
LRRTM2O43300 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.77□□□□□ -2.13
LRRTM2O43300 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
LRRTM2O43300 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC1.77□□□□□ -2.13
LRRTM2O43300 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
LRRTM2O43300 MTND4P18-201ENST00000447010 465 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
LRRTM2O43300 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
LRRTM2O43300 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
LRRTM2O43300 FGF7P4-201ENST00000509595 295 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
LRRTM2O43300 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
LRRTM2O43300 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
LRRTM2O43300 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
LRRTM2O43300 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
LRRTM2O43300 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
LRRTM2O43300 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
LRRTM2O43300 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
LRRTM2O43300 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC1.77□□□□□ -2.13
LRRTM2O43300 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
LRRTM2O43300 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
LRRTM2O43300 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
LRRTM2O43300 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
LRRTM2O43300 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
LRRTM2O43300 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
LRRTM2O43300 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
LRRTM2O43300 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
LRRTM2O43300 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
LRRTM2O43300 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
LRRTM2O43300 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
LRRTM2O43300 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
LRRTM2O43300 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
LRRTM2O43300 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
LRRTM2O43300 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
LRRTM2O43300 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
LRRTM2O43300 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
LRRTM2O43300 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
LRRTM2O43300 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
LRRTM2O43300 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
LRRTM2O43300 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
LRRTM2O43300 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
LRRTM2O43300 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
LRRTM2O43300 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
LRRTM2O43300 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
LRRTM2O43300 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
LRRTM2O43300 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
LRRTM2O43300 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
LRRTM2O43300 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
LRRTM2O43300 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
LRRTM2O43300 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
LRRTM2O43300 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.5 ms