Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC-0.59□□□□□ -2.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC-0.59□□□□□ -2.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IL2-201ENST00000226730 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.6□□□□□ -2.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Y_RNA.391-201ENST00000383933 94 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL049545.1-201ENST00000401856 572 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC-0.6□□□□□ -2.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC-0.6□□□□□ -2.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GYG2-AS1-201ENST00000445107 515 ntTSL 5 BASIC-0.6□□□□□ -2.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC010468.3-201ENST00000508225 458 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC026616.1-201ENST00000523157 525 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DEFB108A-201ENST00000530110 222 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL158211.1-201ENST00000566763 763 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC104072.1-201ENST00000568817 668 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Z99497.2-201ENST00000603634 310 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Z99289.3-201ENST00000605586 594 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 uc_338.36-201ENST00000622331 158 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 snoZ40.1-201ENST00000364540 72 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL590730.1-201ENST00000426283 398 ntTSL 3 BASIC-0.61□□□□□ -2.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00354-202ENST00000440860 376 ntTSL 2 BASIC-0.61□□□□□ -2.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC013828.2-201ENST00000532487 235 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP002453.2-201ENST00000533503 320 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC-0.61□□□□□ -2.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR548AZ-201ENST00000616567 95 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC-0.61□□□□□ -2.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC099654.8-201ENST00000637757 681 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNORD114-28-201ENST00000363610 72 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL158050.1-201ENST00000416077 457 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01676-201ENST00000420901 410 ntTSL 3 BASIC-0.62□□□□□ -2.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00387-201ENST00000422609 458 ntTSL 5 BASIC-0.62□□□□□ -2.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL513412.1-201ENST00000445708 553 ntTSL 4 BASIC-0.62□□□□□ -2.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP000542.1-201ENST00000448473 371 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM212-IT1-201ENST00000456146 470 ntTSL 3 BASIC-0.62□□□□□ -2.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNY4P37-201ENST00000516225 96 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-150P-201ENST00000516237 95 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC010376.1-201ENST00000522101 334 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP003386.1-201ENST00000526509 504 ntTSL 3 BASIC-0.62□□□□□ -2.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DEFB131D-201ENST00000526803 184 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL163973.2-201ENST00000548096 288 ntTSL 3 BASIC-0.62□□□□□ -2.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL352984.1-201ENST00000556949 276 ntTSL 3 BASIC-0.62□□□□□ -2.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL391840.1-201ENST00000571144 367 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR4789-201ENST00000577469 82 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC-0.62□□□□□ -2.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC091588.1-201ENST00000578504 359 ntTSL 3 BASIC-0.62□□□□□ -2.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DEFB131E-202ENST00000602581 683 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FBXW7-AS1-201ENST00000605147 372 ntTSL 1 (best) BASIC-0.62□□□□□ -2.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR3666-201ENST00000607845 111 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC245297.3-203ENST00000612135 405 ntTSL 5 BASIC-0.62□□□□□ -2.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL356596.1-201ENST00000624230 379 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR892B-201ENST00000401279 77 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC-0.63□□□□□ -2.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC-0.63□□□□□ -2.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OCIAD1-AS1-201ENST00000513576 265 ntTSL 3 BASIC-0.63□□□□□ -2.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-180P-201ENST00000516697 61 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC021451.1-201ENST00000523498 1129 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC087260.1-201ENST00000546118 401 ntTSL 5 BASIC-0.63□□□□□ -2.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL592221.1-201ENST00000605266 382 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC100814.1-201ENST00000606963 623 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
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