Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYL9

TMOD3, Tropomodulin-3, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3Q9NYL9 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TMOD3Q9NYL9 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TMOD3Q9NYL9 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
TMOD3Q9NYL9 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
TMOD3Q9NYL9 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TMOD3Q9NYL9 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TMOD3Q9NYL9 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TMOD3Q9NYL9 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TMOD3Q9NYL9 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
TMOD3Q9NYL9 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TMOD3Q9NYL9 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TMOD3Q9NYL9 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
TMOD3Q9NYL9 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TMOD3Q9NYL9 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
TMOD3Q9NYL9 RNU6-358P-201ENST00000516564 75 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TMOD3Q9NYL9 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TMOD3Q9NYL9 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC1.99□□□□□ -2.09
TMOD3Q9NYL9 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TMOD3Q9NYL9 AC084782.3-201ENST00000612282 578 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TMOD3Q9NYL9 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
TMOD3Q9NYL9 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TMOD3Q9NYL9 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TMOD3Q9NYL9 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TMOD3Q9NYL9 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TMOD3Q9NYL9 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TMOD3Q9NYL9 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TMOD3Q9NYL9 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TMOD3Q9NYL9 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
TMOD3Q9NYL9 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TMOD3Q9NYL9 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TMOD3Q9NYL9 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TMOD3Q9NYL9 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TMOD3Q9NYL9 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TMOD3Q9NYL9 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TMOD3Q9NYL9 AC009033.1-201ENST00000624279 431 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TMOD3Q9NYL9 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
TMOD3Q9NYL9 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TMOD3Q9NYL9 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.97□□□□□ -2.09
TMOD3Q9NYL9 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TMOD3Q9NYL9 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TMOD3Q9NYL9 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TMOD3Q9NYL9 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TMOD3Q9NYL9 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TMOD3Q9NYL9 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TMOD3Q9NYL9 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TMOD3Q9NYL9 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TMOD3Q9NYL9 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TMOD3Q9NYL9 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
TMOD3Q9NYL9 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TMOD3Q9NYL9 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
TMOD3Q9NYL9 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TMOD3Q9NYL9 DLGAP1-AS4-201ENST00000582054 757 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
TMOD3Q9NYL9 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TMOD3Q9NYL9 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TMOD3Q9NYL9 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TMOD3Q9NYL9 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TMOD3Q9NYL9 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
TMOD3Q9NYL9 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
TMOD3Q9NYL9 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TMOD3Q9NYL9 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TMOD3Q9NYL9 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TMOD3Q9NYL9 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TMOD3Q9NYL9 AC009480.1-201ENST00000402410 412 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
TMOD3Q9NYL9 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TMOD3Q9NYL9 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TMOD3Q9NYL9 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
TMOD3Q9NYL9 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TMOD3Q9NYL9 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
TMOD3Q9NYL9 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TMOD3Q9NYL9 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TMOD3Q9NYL9 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
TMOD3Q9NYL9 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
TMOD3Q9NYL9 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
TMOD3Q9NYL9 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
TMOD3Q9NYL9 MTND4P5-201ENST00000435821 1374 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TMOD3Q9NYL9 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
TMOD3Q9NYL9 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
TMOD3Q9NYL9 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
TMOD3Q9NYL9 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TMOD3Q9NYL9 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TMOD3Q9NYL9 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TMOD3Q9NYL9 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TMOD3Q9NYL9 RNU6ATAC25P-201ENST00000408798 117 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TMOD3Q9NYL9 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TMOD3Q9NYL9 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TMOD3Q9NYL9 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TMOD3Q9NYL9 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
TMOD3Q9NYL9 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TMOD3Q9NYL9 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
TMOD3Q9NYL9 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TMOD3Q9NYL9 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TMOD3Q9NYL9 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TMOD3Q9NYL9 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TMOD3Q9NYL9 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TMOD3Q9NYL9 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TMOD3Q9NYL9 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TMOD3Q9NYL9 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
TMOD3Q9NYL9 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
TMOD3Q9NYL9 U6atac.1-201ENST00000616025 117 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TMOD3Q9NYL9 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.6 ms