Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 SLITRK5-201ENST00000325089 21103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
TIMMDC1Q9NPL8 EFR3A-208ENST00000637848 2547 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
TIMMDC1Q9NPL8 AL033397.1-201ENST00000502390 3653 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
TIMMDC1Q9NPL8 PCLO-206ENST00000437081 3786 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
TIMMDC1Q9NPL8 CNOT2-231ENST00000551483 4753 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
TIMMDC1Q9NPL8 RNF180-202ENST00000389100 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
TIMMDC1Q9NPL8 TM4SF18-201ENST00000296059 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
TIMMDC1Q9NPL8 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
TIMMDC1Q9NPL8 MGA-211ENST00000570161 11859 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
TIMMDC1Q9NPL8 POLK-201ENST00000241436 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TIMMDC1Q9NPL8 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TIMMDC1Q9NPL8 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TIMMDC1Q9NPL8 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TIMMDC1Q9NPL8 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
TIMMDC1Q9NPL8 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TIMMDC1Q9NPL8 YME1L1P1-201ENST00000429435 297 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TIMMDC1Q9NPL8 AC105398.1-201ENST00000446073 402 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
TIMMDC1Q9NPL8 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
TIMMDC1Q9NPL8 RNA5SP49-201ENST00000516450 115 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TIMMDC1Q9NPL8 MIR8059-201ENST00000620427 81 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TIMMDC1Q9NPL8 MIR7702-201ENST00000621931 59 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TIMMDC1Q9NPL8 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00971-202ENST00000484892 7308 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
TIMMDC1Q9NPL8 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
TIMMDC1Q9NPL8 GCSAML-203ENST00000366491 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
TIMMDC1Q9NPL8 RNU1-14P-201ENST00000362759 152 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
TIMMDC1Q9NPL8 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
TIMMDC1Q9NPL8 MIR1911-201ENST00000410783 80 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
TIMMDC1Q9NPL8 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
TIMMDC1Q9NPL8 AL157831.1-201ENST00000426134 473 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
TIMMDC1Q9NPL8 RBMY2UP-201ENST00000453474 324 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
TIMMDC1Q9NPL8 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
TIMMDC1Q9NPL8 AC023141.12-201ENST00000512399 199 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00491-204ENST00000513815 582 ntTSL 4 BASIC3.94□□□□□ -1.78
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
TIMMDC1Q9NPL8 AC084398.2-201ENST00000551918 564 ntTSL 4 BASIC3.94□□□□□ -1.78
TIMMDC1Q9NPL8 AC007224.1-201ENST00000564410 144 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
TIMMDC1Q9NPL8 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
TIMMDC1Q9NPL8 AC011461.1-201ENST00000592671 357 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
TIMMDC1Q9NPL8 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
TIMMDC1Q9NPL8 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
TIMMDC1Q9NPL8 CCL14-203ENST00000620991 426 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
TIMMDC1Q9NPL8 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
TIMMDC1Q9NPL8 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
TIMMDC1Q9NPL8 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
TIMMDC1Q9NPL8 MBD5-212ENST00000627651 5610 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01733-201ENST00000449316 4604 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
TIMMDC1Q9NPL8 SPAG17-201ENST00000336338 6924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
TIMMDC1Q9NPL8 PPIP5K2-201ENST00000321521 15407 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
TIMMDC1Q9NPL8 CLIC2-202ENST00000369449 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
TIMMDC1Q9NPL8 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF616-201ENST00000330123 2563 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
TIMMDC1Q9NPL8 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
TIMMDC1Q9NPL8 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
TIMMDC1Q9NPL8 CRYBB2P1-203ENST00000415709 538 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
TIMMDC1Q9NPL8 AC017083.1-201ENST00000428093 483 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
TIMMDC1Q9NPL8 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
TIMMDC1Q9NPL8 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
TIMMDC1Q9NPL8 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
TIMMDC1Q9NPL8 RNA5SP73-201ENST00000516744 108 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
TIMMDC1Q9NPL8 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
TIMMDC1Q9NPL8 AC068724.3-201ENST00000625906 87 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
TIMMDC1Q9NPL8 PIGW-206ENST00000620233 2264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
TIMMDC1Q9NPL8 AC007496.3-201ENST00000624987 3443 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
TIMMDC1Q9NPL8 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
TIMMDC1Q9NPL8 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
TIMMDC1Q9NPL8 AC087521.2-201ENST00000499066 2190 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
TIMMDC1Q9NPL8 FRYL-205ENST00000503238 11103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
TIMMDC1Q9NPL8 TFEC-201ENST00000265440 6628 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
TIMMDC1Q9NPL8 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
TIMMDC1Q9NPL8 RPL23AP46-201ENST00000438548 490 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
TIMMDC1Q9NPL8 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
TIMMDC1Q9NPL8 RPL29-203ENST00000475248 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SL691P-201ENST00000494487 301 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
TIMMDC1Q9NPL8 RNA5SP519-201ENST00000516480 119 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
TIMMDC1Q9NPL8 AC026992.1-202ENST00000558454 421 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
TIMMDC1Q9NPL8 AC009137.1-201ENST00000562790 260 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF616-203ENST00000597013 577 ntTSL 4 BASIC3.92□□□□□ -1.78
TIMMDC1Q9NPL8 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
TIMMDC1Q9NPL8 AC068647.1-201ENST00000489539 2265 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
TIMMDC1Q9NPL8 ADGRG4-203ENST00000394143 9931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
TIMMDC1Q9NPL8 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
TIMMDC1Q9NPL8 THEMIS-202ENST00000368250 4101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
TIMMDC1Q9NPL8 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
TIMMDC1Q9NPL8 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
TIMMDC1Q9NPL8 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
TIMMDC1Q9NPL8 NDUFB1P1-201ENST00000435191 180 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
TIMMDC1Q9NPL8 RNU7-170P-201ENST00000459303 61 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
TIMMDC1Q9NPL8 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
TIMMDC1Q9NPL8 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
TIMMDC1Q9NPL8 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
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