Protein–RNA interactions for Protein: Q99966

CITED1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, humanhuman

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Length 193 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1Q99966 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
CITED1Q99966 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CITED1Q99966 AP000907.4-201ENST00000604143 237 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CITED1Q99966 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CITED1Q99966 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CITED1Q99966 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
CITED1Q99966 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
CITED1Q99966 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
CITED1Q99966 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CITED1Q99966 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CITED1Q99966 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CITED1Q99966 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CITED1Q99966 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CITED1Q99966 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CITED1Q99966 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CITED1Q99966 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CITED1Q99966 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CITED1Q99966 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CITED1Q99966 MTCO1P21-201ENST00000416634 589 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CITED1Q99966 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CITED1Q99966 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
CITED1Q99966 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CITED1Q99966 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CITED1Q99966 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CITED1Q99966 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CITED1Q99966 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CITED1Q99966 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
CITED1Q99966 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CITED1Q99966 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CITED1Q99966 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
CITED1Q99966 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CITED1Q99966 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CITED1Q99966 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CITED1Q99966 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CITED1Q99966 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CITED1Q99966 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CITED1Q99966 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
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CITED1Q99966 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CITED1Q99966 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
CITED1Q99966 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CITED1Q99966 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CITED1Q99966 RNY4P14-201ENST00000363656 96 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CITED1Q99966 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CITED1Q99966 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CITED1Q99966 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CITED1Q99966 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CITED1Q99966 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CITED1Q99966 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
CITED1Q99966 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CITED1Q99966 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CITED1Q99966 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
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CITED1Q99966 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
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CITED1Q99966 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
CITED1Q99966 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CITED1Q99966 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CITED1Q99966 AP005120.1-201ENST00000579321 352 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
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CITED1Q99966 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
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CITED1Q99966 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
CITED1Q99966 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CITED1Q99966 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CITED1Q99966 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
CITED1Q99966 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
CITED1Q99966 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
CITED1Q99966 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CITED1Q99966 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CITED1Q99966 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
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CITED1Q99966 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
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CITED1Q99966 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
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CITED1Q99966 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
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CITED1Q99966 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
CITED1Q99966 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CITED1Q99966 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CITED1Q99966 Y_RNA.450-201ENST00000384198 113 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CITED1Q99966 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CITED1Q99966 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CITED1Q99966 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.47□□□□□ -2.17
CITED1Q99966 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
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