Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
PDK4Q16654 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PDK4Q16654 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PDK4Q16654 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PDK4Q16654 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PDK4Q16654 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PDK4Q16654 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PDK4Q16654 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PDK4Q16654 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PDK4Q16654 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PDK4Q16654 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC1.33□□□□□ -2.2
PDK4Q16654 MRPS10P2-201ENST00000431226 381 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PDK4Q16654 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PDK4Q16654 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PDK4Q16654 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PDK4Q16654 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PDK4Q16654 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
PDK4Q16654 AC098862.1-201ENST00000504991 413 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PDK4Q16654 LINC02500-201ENST00000512547 493 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
PDK4Q16654 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PDK4Q16654 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PDK4Q16654 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PDK4Q16654 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PDK4Q16654 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PDK4Q16654 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PDK4Q16654 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PDK4Q16654 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PDK4Q16654 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PDK4Q16654 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
PDK4Q16654 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PDK4Q16654 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
PDK4Q16654 AC010486.3-201ENST00000511602 785 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PDK4Q16654 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
PDK4Q16654 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PDK4Q16654 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC1.32□□□□□ -2.2
PDK4Q16654 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
PDK4Q16654 MTND3P12-201ENST00000559068 328 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PDK4Q16654 AP003465.2-201ENST00000602571 373 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PDK4Q16654 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PDK4Q16654 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PDK4Q16654 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PDK4Q16654 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PDK4Q16654 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PDK4Q16654 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PDK4Q16654 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PDK4Q16654 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PDK4Q16654 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PDK4Q16654 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PDK4Q16654 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PDK4Q16654 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PDK4Q16654 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PDK4Q16654 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PDK4Q16654 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PDK4Q16654 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PDK4Q16654 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
PDK4Q16654 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
PDK4Q16654 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PDK4Q16654 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PDK4Q16654 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PDK4Q16654 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PDK4Q16654 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PDK4Q16654 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PDK4Q16654 AL133368.2-201ENST00000556978 386 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
PDK4Q16654 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PDK4Q16654 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
PDK4Q16654 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PDK4Q16654 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PDK4Q16654 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PDK4Q16654 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PDK4Q16654 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PDK4Q16654 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PDK4Q16654 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PDK4Q16654 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PDK4Q16654 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PDK4Q16654 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PDK4Q16654 EIF1P1-201ENST00000421436 341 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PDK4Q16654 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PDK4Q16654 TPT1P7-201ENST00000458300 517 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PDK4Q16654 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PDK4Q16654 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PDK4Q16654 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PDK4Q16654 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
PDK4Q16654 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PDK4Q16654 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PDK4Q16654 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PDK4Q16654 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PDK4Q16654 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
PDK4Q16654 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PDK4Q16654 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PDK4Q16654 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PDK4Q16654 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PDK4Q16654 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PDK4Q16654 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.29□□□□□ -2.2
PDK4Q16654 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PDK4Q16654 USP9YP14-201ENST00000430663 563 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PDK4Q16654 MTCO2P16-201ENST00000436962 677 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PDK4Q16654 MTND1P26-201ENST00000440488 538 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PDK4Q16654 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC1.29□□□□□ -2.2
PDK4Q16654 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
PDK4Q16654 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120 ms