Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SNAPC1Q16533 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SNAPC1Q16533 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SNAPC1Q16533 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SNAPC1Q16533 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SNAPC1Q16533 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SNAPC1Q16533 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SNAPC1Q16533 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SNAPC1Q16533 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SNAPC1Q16533 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SNAPC1Q16533 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
SNAPC1Q16533 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SNAPC1Q16533 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SNAPC1Q16533 MTND3P10-201ENST00000450967 341 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SNAPC1Q16533 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SNAPC1Q16533 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SNAPC1Q16533 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SNAPC1Q16533 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SNAPC1Q16533 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SNAPC1Q16533 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SNAPC1Q16533 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SNAPC1Q16533 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SNAPC1Q16533 RBM11P1-201ENST00000604951 799 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SNAPC1Q16533 AL355073.2-201ENST00000612106 557 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SNAPC1Q16533 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SNAPC1Q16533 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SNAPC1Q16533 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SNAPC1Q16533 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 AC134698.4-201ENST00000523451 826 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SNAPC1Q16533 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.3 ms