Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 AP005530.1-201ENST00000572608 567 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 AP000907.4-201ENST00000604143 237 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 RNU6-623P-201ENST00000363143 105 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.35□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 MTCO1P21-201ENST00000416634 589 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 AL138799.4-201ENST00000443939 643 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC1.35□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 AC012557.2-201ENST00000605919 418 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC1.34□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 RNU6-720P-201ENST00000516363 108 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 AC025917.1-202ENST00000566344 635 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 AC090617.10-201ENST00000624308 134 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.2
ATP6AP1Q15904 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ATP6AP1Q15904 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ATP6AP1Q15904 RNY4P14-201ENST00000363656 96 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ATP6AP1Q15904 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ATP6AP1Q15904 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ATP6AP1Q15904 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ATP6AP1Q15904 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ATP6AP1Q15904 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ATP6AP1Q15904 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ATP6AP1Q15904 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ATP6AP1Q15904 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ATP6AP1Q15904 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ATP6AP1Q15904 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
ATP6AP1Q15904 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ATP6AP1Q15904 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
ATP6AP1Q15904 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ATP6AP1Q15904 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ATP6AP1Q15904 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ATP6AP1Q15904 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
ATP6AP1Q15904 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ATP6AP1Q15904 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
ATP6AP1Q15904 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ATP6AP1Q15904 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
ATP6AP1Q15904 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
ATP6AP1Q15904 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.450-201ENST00000384198 113 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ATP6AP1Q15904 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 167.5 ms